1、臨床三年行動計劃是針對整個醫療機構或醫療系統的長期發展目標和戰略規劃，目的是制定並指導該機構或系統在臨床方面的改進和發展，涵蓋了多個臨床領域和專業，並具有較高的層次和戰略性，而三年行動方案是在臨床三年行動計劃的基礎上，具體細化和落實的壹系列具體行動和措施，更加具體、可操作性強，是在臨床實踐和服務層面上進行規劃和實施。
2、臨床三年行動計劃涵蓋的範圍更廣泛，包括臨床研究、醫療質量改進、臨床流程優化、人員培訓等多個方面，其時間跨度為三年或更長，而三年行動方案是在短期內（為三年）針對某個具體問題或目標制定的行動計劃，目的是通過具體的行動來達成特定的目標或解決特定的問題。