1、學制長度：三年制指的是學生在中央音樂學院附中就讀三年，而六年制指的是學生在中央音樂學院附中就讀六年。
2、學習內容：三年制和六年制在學習內容上存在差異。三年制註重基礎教育的全面發展，包括音樂和普通教育科目的學習。六年制則更加專註於音樂專業的訓練和培養，音樂課程更加深入和專業化。
3、學業壓力與適應時間：六年制相對於三年制來說，學生會有更長的學習時間來適應音樂專業的要求和學術壓力。六年制給予學生更多的時間去培養技能和深入研究音樂領域。
4、畢業資格：三年制和六年制在畢業後所獲得的資格也不同。三年制學生畢業後會獲得高中畢業證書，而六年制學生畢業後可以獲得中等音樂學校的畢業證書。