甲型流感病毒是依據病毒表面的血細胞凝集素（H）和神經氨酸酶（N）來命名，其中H有16個亞型，N有9個亞型。H5N6禽流感是禽流感病毒的壹種亞型。2016年1月深圳市疾控中心確認深圳H5N6病例病毒基因已確定。