1997年，成立欽州市工商行政管理局欽州港分局，是欽州市工商行政管理局的派出機構，負責組織實施欽州港經濟開發區的工商行政管理工作。1998年，有管理人員14人。2001年，工商機構改革，工商行政管理機關代管的市場開發服務中心及其主辦、聯辦的各類市場移交當地政府，與工商行政管理部門脫鉤。是年，欽州市工商局欽州港分局在編公務員8人。2002年，分局內設機構更為政秘科、監管與執法股、登記註冊股3個科股。至2010年，在編人員11人。分局內設人秘股、登記註冊股、監管與執法股3個職能股室。
1997年以前工商登記由欽南區工商行政管理轄。1998年，欽州港登記在冊的工商戶103戶，私營企業3家。2000年，有個體工商戶355戶，工業企業20戶，從業人員589人(其中個體戶441人，企業戶148人)，註冊資金1 521.6萬元(其中個體戶224萬元，企業戶1 297.6萬元)。其中從事批發零售貿易、餐飲業的個體工商戶占總數的80%，服務業占16%，制造業占4%。2002年12月底，工商登記的個體工商戶475戶，私營企業22戶。比2000年新增個體戶120戶，企業戶21戶。個體工商戶從業人員562人，比2000年增加121人，企業從業人員421人。註冊資金達4 707.23萬元，其中個體戶286.73萬元，企業戶4 420.5萬元。
2003—2009年，欽州港個體經濟呈直線發展趨勢，其主要是港區的商業網點由起初欽州港市場周邊的商業逐漸向四面擴展。隨著港區城區的框架拉大，房地產開發所建的鋪面、步行街、地下商場、居民永久房的回建等，各項商業的門面由欽州港市場為中心向欽州港大道、興港路、逸仙路、勒溝西大街臨街延申，以及向東港區片發展。7年間新增登記註冊個體工商戶***1505戶，平均年增215戶，其中2008、2009年新增數額最大，分別為776戶和305戶，後兩年新增戶數是前5年的2.55倍；新增私營企業493戶，平均年增70多戶，2008和2009年新增最多，其中2009年新增277戶，是2003—2007年5年新增總和的2.43倍。2009年欽州港區個體工商戶已發展到1 920戶，從業人員發展到3 126人，註冊資金達到4 927萬元；私營企業發展到277戶，註冊資金達到35 075萬元，投資人數達到432人，從業人員達到2 545人。
2010年5月，個體工商戶發展到1 989戶(新發展154戶)，從業人員3 109人，註冊資金達5 720萬元；私營企業發展到323戶(新發展40戶)，註冊資金達41 501萬元。是年底，欽州港區的個體工商已戶發展到2 006戶，本年度發展了359戶，比上年增長22%，從業人員發展到3 917人，比上年增長38%，註冊資金達到6 699萬元，比上年增長36%；私營企業發展到348戶，其中，當年新發展 72戶，比上年 增長26%，註冊資金達到44 329萬元，其中新增註冊資金8 264萬元，同比增長26%，從業人員達到2 536人，比上年增長28%。