中醫學理論體系是由有關事物互相聯系、互相制約而構成的壹個整體。
1、元氣論是中醫理論體系的哲學基礎
元氣論作為壹種自然觀貫穿於中醫理論體系的各個方面，如用於說明生命過程的物質性和運動性；說明人體的整體性和聯系性，解釋人體各種生理、病理現象等，它是中醫學的哲學基礎。
2、陰陽五行學說是中醫理論體系的方法論
陰陽五行學說是人們認識自然、解釋自然的方法論，具有高度的概括性和思辨性，以其陰陽兩分法進行說理，闡明人體的形態結構，生理機能，病理現象，分析致病因素及抗病能力，劃分中藥屬性等。人的生命機體物質性、運動性、聯系性都能用陰陽雙方既對立又統壹的概念來說明。
3、臟腑經絡理論是中醫理論體系的核心
醫學研究的對象是人。人在醫學概念中具備以下三個特征：壹是人的生物學概念，即具有鮮活生命的有機體；二是社會學概念，即人在壹定社會地位中生活，每個人都在社會上扮演壹定角色；三是心理學概念，即人不同於壹般動物，有高度發達的智慧，有思維、心理活動，是“萬物之靈”。人的這三種特征，經常處於發展變化當中，時常影響著人的生理機能和病理過程。