MD5大作戰先後有多個版本，如1.03、1.04、1.10、1.20、1.30。不同的版本，字符串屬性及戰鬥過程都有可能不同。1.20與1.30之間還出過群戰的2.0，但反響不大。
其中，（1）.1.03和1.04版本中，相同字符串的屬性以及相同字符串之間的戰鬥是相同的（這兩個版本經常會遇到不同字符串之間各項數據完全相同的情況，且有規律可循）；（2）.1.10、1.20和1.30版本中，相同字符串的屬性是相同的，但相同字符串之間的戰鬥不相同（這三個版本也有不同字符串之間各項數據完全相同的情況，也有壹定規律，但數目已大幅度減少）；而（1）（2）中提到的不同版本，相同字符串的屬性和戰鬥壹般不同。
註：完全用數字、字母和半角符號的，不區分版本。