貫徹落實《國務院辦公廳關於加強環境監管執法的通知》存在不到位的情況。2016年1月，省政府向國務院報送《關於環境保護大檢查和環境監管網格劃分工作總結的報告》中稱“對各地飲用水水源保護區進行排查，未發現違法違規排汙口和違法違規建設項目，國家級自然保護區內未發現違法開發和建設項目”。但督察發現：九江市河西水廠、豐城市集中式飲用水水源壹級保護區內建有碼頭，宜春市松江園黑臭水體直接排入灘下水廠飲用水水源壹級保護區內；宜春市九嶺山國家級自然保護區緩沖區內違規建設森林小火車旅遊項目，贛州市九連山國家級自然保護區核心區內建有漢華蔬菜基地、實驗區內建有龍九水電站等違規項目。