在徐經業等人建塔期間，東湖縣的佛教居士和僧侶向徐經業等提出在塔旁修建寺廟的請求，得到許可後在天然塔旁修建了寺院。院內設有禪堂、齋房、僧舌、會客室等與亭、榭多座，還有花園、場坪，占地面積達30余畝，其中僅塔與殿堂及附屬房屋占地達10余畝，命名為“天然塔廟”。廟門朝東北，修有壹條寬近10米、長30余米的廣闊通道。通道兩旁植有松柏樟桐等各種樹木，院內花園內植有各種花卉。
時任清東湖知縣的明佩有此雲：“越葵醜初夏而塔以成……又構剎其旁，壹切禪堂佛座之莊嚴，亭、榭、花木之壯麗，凡來登眺者，鹹稱為勝地。”
天然塔自建成之後，成為了宜昌的重要名勝古跡和旅遊勝地。除此之外，天然塔也是長江三峽的重要古航標，夜間，七樓上還有為航行船舶點的指路明燈。壹位熟知天然塔的市民告訴記者，天然塔建造的地理位置非常奇特，無論是在上遊還是在下遊乘船，都可以看到這座寶塔。然而，在解放前夕，天然塔卻遭受了日軍和國民黨的破壞，並逐漸沒落。1940年，宜昌淪陷後，天然塔廟及其園林遭到日軍的嚴重破壞。到1945年宜昌光復時，殘存有廟宇2棟，建築面積約500平方米和田園20余畝，由宜昌佛教會僧人耕作管理。
1947年，國民黨派學兵派占據部分廟宇，將場坪作為練兵場，隨意摧毀林木花卉；又因主持僧吸鴉片，懶於勞作和管理，使天然塔的遊客銳減，直至衰落。
至解放前夕，天然塔處僧去廟毀，成為廢墟，田園荒蕪，野草叢生，呈現出壹片淒涼景象，僅余天然塔仍然屹立在長江邊，安然無恙。壹位長期居住在天然塔附近的市民告訴記者，在上世紀五六十年代，年幼的他便與兒時的玩伴經常來“寶塔”玩，當時還可以看到塔基上有許多各種形象的石雕羅漢，背負著“寶塔”，塔頂上還有壹座銅人，但在上世紀六七十年代，這些珍貴的文物都被破壞。