《阿凡達2》的劇情承接自初代的5年之後。
曾經的地球殘疾軍人傑克·薩利，如今已經是潘多拉星球納美族壹方部族的族長，並且與愛妻娜塔莉***同育有壹對可愛的兒女，日子過得平淡而充實。壹個清冷的雨夜，傑克忽然回想起他過去的人類生活，那些來到潘多拉之前的日日夜夜。那個時候的地球，生態環境已經因為人類的種種破壞而瀕臨崩潰，各種大小天災接連不斷，必須依靠去外星強取豪奪各類資源才能勉強維持生存，而潘多拉星球的寶貴礦產和自然資源，也許是能夠挽救地球的重要力量，更是他們覬覦已久的對象。此時的傑克心裏十分清楚，想要人類放棄征服潘多拉的計劃是不可能的，必須隨時保持高度的警惕。
就在這時，有手下人跑來告訴他，有個部族的兄弟在海岸附近巡邏時遭到利器割喉身亡。通過現場勘查，以及作為前海軍陸戰隊員的敏銳直覺，傑克判斷已經有人類的阿凡達混入了部落。然而娜塔莉告訴他這是不可能的，因為阿凡達身上的氣味與壹般納美人的氣味大相徑庭，如果是阿凡達混了進來應該早就被察覺了。但是傑克深信自己的直覺，他知道以現今地球科學家的技術水準，經過幾年的發展培育出與納美人毫無二致的阿凡達也並非不可能的事。何況利刃割喉的手法，很像傑克過去接受特種培訓時的手段。可是，又如何才能把這個潛在的對手查出來呢?
接下來的劇情就要看真正上映的影片了