臨床發現部分乙肝病毒攜帶者可出現病毒自然轉陰現象，據統計其年平均轉陰率為1%～2%。目前認為乙肝病毒攜帶者能否自然轉陰可能與某些因素有關，據統計15歲以上成年組HBsAg陰轉率高於1～14歲兒童組；HBsAg低滴度組（≤1∶128）的陰轉率高於高滴度組（＞1∶256）；HBeAg陰性者的HBsAg陰轉率高於HBeAg陽性者。
乙肝病毒攜帶者，如肝功能、B超、AFP（甲胎蛋白）及白細胞、血小板等正常情況，壹般不必治療，因為目前所有的抗病毒療法及免疫調節療法都無明顯療效，盲目的地服用“轉陰”藥物，有時不僅達不到目的，反可誘發肝炎，使攜帶者變為肝炎患者；對於壹部分乙肝病毒攜帶者中HBV-DNA也陽性，其中有壹部分人的肝臟可能有炎癥，實際上是慢性肝炎，如出現肝功能異常，則需酌情考慮抗病毒治療。