中國水利投資集團公司的組織機構

總經理辦公室、規劃發展部、投資開發部、財務中心、資本運營與股權管理部、經營管理部（法律事務部、國際合作部、安全生產辦公室）、組織人事部（離退休工作部）、黨群工作部（紀檢監察室）、審計監督部、資產運營管理中心。

09年6月公司內部重新進行機構設置，具體為總經理辦公室，計劃發展部、建設管理部、經營管理部、資產財務部、人力資源部、安全生產部、風險控制部、黨群工作部。