12月24日，即杭州淪陷之日，浙大開始撤離建德，師生們走上了極其困難的赴贛歷程。
浙大這次從建德向江西吉安搬遷，不像離杭時那樣匆促、忙亂，而是更有組織、更有秩序。學生分若幹隊，每隊都有導師壹二人率領。蘭溪、金華、常山、玉山、南昌、樟樹、吉安等地各設接待站。學生和教職工及眷屬分三批依次在建德上了民船，到蘭溪後，有的步行，有的換乘小船，溯梅溪而抵金華。
12月26日，浙江金華遭到日寇三架重型轟炸機的狂炸，城內創痕滿目，浙大的大批師生幸未遭害，但身經其險。竺校長於次日到達金華，也遭遇日機的轟炸，落彈點離他所在的地方不遠，幸未受傷。金華連遭日寇轟炸，轉瞬之間，市面繁榮頓歇，居民逃避壹空。日本侵略軍越錢搪江而直指金華的消息不脛而走，搞得人心惶惶，不可終日。這時浙贛鐵路因軍運關系，客貨車都已停開，而人民逃難如潮。因此，浙大部分教職員和學生，只得集結在金華的幾個臨時處所。由於柴米難得，許多人已空腹多時。四壁蕭條，饑腸轆轆，時值寒冬，凍坐終夜。在這種情況下，浙大師生沒有消沈，而是更堅定了堅持奮鬥的決心，有的交涉兵車附行，有的沿鐵路安步當車，有的攀上煤車、敞蓬車、難民車和兵車西行，冒受風雨，嘗盡饑寒。隨兵車附行的，往往要在六七天後才能到達南昌。有壹部分後走尚在建德的師生，聽到金華被炸的消息，便要所乘的船，溯水路直放衢縣，轉到常山，再設法往江西，幾經周折，才將這些師生用汽車分批送抵玉山。
江西玉山，是當時浙贛鐵路總局所在地。浙大的所有人員，不管是搭車的、乘船的、步行的，先先後後，陸陸續續，總算平安匯集在玉山。但有700多箱圖書儀器，裝了30多艘民船，卻停泊在金華鐵路車站西面不遠的河面上。在這樣的危難時刻，浙大負責押運的教師、職工，四處奔波設法，並親自動手，將物件分裝在兵車、煤車和貨車上，到1938年1月6日夜間，才將所有滯留的校產，運離秩序混亂的金華，到達江西玉山。
但是，當時在玉出要找火車車皮運送浙大師生到吉安附近的樟樹鎮，簡直此登天還難。為此，竺可楨從1937年12月28日起在玉山停留十壹天，在小雪斷續、北風勁吹的玉山四處奔波，托人求情，聯系車輛。直到1月7日鐵路局才同意拔10余節車皮給浙大使用，實際上又過兩天之後，總算在貴溪聯系到壹低鉤車頭，才將浙大師生和圖書儀器運往江西樟樹鎮。而另外乘在壹列客車上的師生，卻不知下落，經竺校長再三查詢，方知該車廂竟被甩在江西鄉間的向塘，這些師生飽嘗困頓壹星期後，才披運抵樟樹鎮。
從1937年12月24日到次年1月20日，浙大師生從浙江建德出發，經金華、玉山、樟樹，轉抵江西吉安，行程752公裏，平均每天前進30公裏，飽受了驚嚇和風霜之苦，經受了考驗和鍛煉，幸而人員、物資都無損失，平安到達目的地。 這次遷校的目的地是泰和，由於戰局發展迅速，浙大提前遷離建德，泰和的房舍來不及準備就緒，而吉安卻有兩所學校正放寒假，房舍空著，所以就借了來，作為浙大臨時落腳之地。
吉安在江西中部，位於贛江及其支流禾水匯合處。這裏是宋代著名文學家歐陽修和民族英雄文天祥的故鄉。中國第壹個農村革命根據地，就在吉安地區的井岡山建立。
浙大遷到吉安後，教職員住在鄉村師範，眷屬租用了當地壹些居民住房，學生則全部住入白鷺洲上的吉安中學。為了不致荒廢學業，利用鄉村師範和吉安中學放寒假期間，學校決定借屋暫行上課，以結束壹學期的課程。因有吉安中學的壹些現成設備，不用花很多力量，所以此較方便。學生上課兩周，接著進行期末考試，然後休息壹周，便準備南行40公裏，深入泰和鄉間。
2月中旬，吉安中學與鄉村師範的寒假已告期滿，浙大師生即於2月18日由水路（贛江）和陸路（贛粵國道）遷移到泰和。浙大離去後不久，白鷺洲便遭到日寇飛機的轟炸。 泰和又名白下，千裏贛江自南往北穿越而去，贛粵國道沿江而行。浙江大學臨時校址就在泰和城西2?5公裏的上田村。該村古時有兩座書院，即大原書院（又名千秋書院）和華陽書院，還有趣園和遐觀摟（即藏書樓），當車遠道學子負笈來學，文風之盛，可與白鷺洲書院相當。浙大師生抵達泰和後，稍事安頓，便繼續教學，科學研究也未停頓。學生黎明即起，在朝陽之下，漫山遍野，朗誦默讀。白天不夠，又復三更燈火，埋頭苦讀。為了要補足搬遷期間所受到的影響，各學院的課程和實驗，都比以前有所增多。無論教職工和學生，工作時間和學習時間都自覺延長。於天目山開始實行的導師制在這裏地繼續貫徹，師生之間相互切磋砥礪，關系更為親密。大局勢如此紛亂急迫，這裏的小環境卻如此有條不紊，這在抗戰時期國內各大學中是不多見的。當時教育部派人到全國各地巡視，認為浙大是所有西遷大學中教學秩序和教學質量堅持得最好的壹所。
在泰和時期，由於戰亂，物資缺乏，浙大師生家屬生活極其艱苦。竺可楨校長廉潔儉樸，壹心為公，公而忘私，更是處處為人表率，他忙於遷校事宜，無暇顧家，甚至夫人張俠魂和次子竺衡身患重病瘧疾也無法顧及，由於醫療技術和藥品缺乏，竺校長的夫人和次子竺衡先後病逝於泰和。
不過，廣大師生並沒有忘記外部世界，讀書不忘抗戰。由於浙大搬遷所經的建德、泰和等地，都無日報，不能及時看到其他報刊，消息閉塞。為改變這種狀況，浙大組織了情報委員會，從建德起就出版《浙大日報》。利用自備的無線電收音機，夜間收聽記錄新聞消息，予以摘編，先是用壁報形式張貼，接著在建德鉛印20多期，到泰和後，沒有鉛印條件，改為油印發行。每期由每天的晚上九時起，到次日上午九時止，分別由工讀學生（勤工儉讀學生，當時稱為工讀學生）和職員二人收聽和記錄，上午十時編好，接著刻印，十二時左右發行，並由工讀學生上街叫賣，頗受當地群眾歡迎。內容除國內外新聞外，並酌登校聞、論著、通訊。
浙大的師生還先後多次進行救亡宣傳，演出了《蘆溝橋》、《漢奸的末路》、《中華民族子孫》等話劇，十幾裏外的村民都趕來觀看；浙大學生還到泰和、吉安乃至贛州宣傳演出，募集救護傷兵的捐款；浙大教授組織前線慰勞隊，赴漢□轉到前線慰勞，節約自己的膳食費作為捐款。影響所及，小學生們也熱烈響應。同仇敵愾之氣壹時激蕩贛江上遊各地。
浙大師生抗日熱情很高，開展了許多抗日活動。如學生自治會發起給前方將士捐獻棉背心，竺可楨就命拔出兩間房子作縫制場所，帶頭捐獻以供制作費用，並常和夫人到制作場鼓勵，夫人張俠魂更多次到現場指導。以後學生自治會又發起募捐活動，竺可楨夫婦率先捐獻了他們的結婚戒指。夫人張俠魂還發起在1938年7月7日舉行七七蘆溝橋抗戰壹周庫紀念活動，並親自撰文以誌紀念。
浙江大學師生留住泰和期間，為當地人民做了三件好事：修築防洪大堤，創設澄江學校，協助開辟沙村墾殖場。
修築防洪大堤是有益民生的急事。因贛江主流所經，兩岸大多為平原，泥沙淤積，夏天大雨時，幾乎年年泛濫。上田村的樓壁墻角，已往的水痕斑斑可見。當地人民雖屢遭水害，但因無力防治，也就習以為常。浙大到來了解這壹情況後，即與江西省水利局及泰和縣政府三方商量，決定修築防洪堤，由地方出錢，浙大負責全部技術工作。為此，組成堤工委員會，推選竺校長為主任委員，由浙大土木系的工讀學生在教師指導下測量水位和提基，4月底開工，到6月底完工，歷時二個月。防洪堤東起泰和縣城，西至梁家村，全長7?5公裏，所有土方、涵洞、水閘等工程都如期完成，堤工最多時增到800人。雖當年恰逢雨量少，未發水災；第二年即發洪水，當地人民未遭水害，都稱崇浙大的功勞。此後，上田村壹帶未再遭水災。新中國成立後，政府屢次組織民工加固堤防，但當地群眾特別是老年人，仍然贊揚浙大師生在抗戰時興建的浙大防洪堤。江邊還設有壹碼頭，當時叫浙大碼頭，這個名稱壹直延用至今，也是浙大曾在泰和停留的永久的美好的紀念。
創設澄江學校(贛江流經泰和的壹段，又名澄江)。浙大推選四位教授組成校董會，由熱心教學的大學生兼任教師，改變了原來農村小學師資程度低下、設備缺乏等狀況，使得農村兒童和搬遷中的浙大教職工子弟得到比較良好的教育。
協助開辟沙村墾殖場。到1938年，抗日戰爭的烽火已迫使不少蘇、浙、皖的群眾流離失所，有的難民來到了江西，缺定生活依靠，於是浙大和江西省政府商議合辦墾殖場，以解決壹部分人的居住和生計問題。沙村附近高壟壹帶有荒田600余畝，建立了沙村示範墾殖場，由浙大土木系工讀學生勘定、測繪，並由農學院負責主持籌劃，有兩位浙大畢業生具體指導，安置了140名戰區難民，墾荒耕種，集體經營，即使難民的生活有所著落，也使農墾事業有所推迸。竺校長對泰和縣農村衰敗、人丁銳減的情況也甚為關切，特地囑托在墾殖場工作的兩位畢業生對吉安地區11個縣區的部分鄉村進行雕查，他們靠步行整整雕查了三個月，獲得了當地農村的不少情況和資料。
浙大還做了壹件意義重大、有利於保存民族文化瑰寶、免遭戰火之災的好事，就是協助浙江省搬運文瀾閣的四庫全書到安全處所。清乾隆時編纂的四庫全書，當時***抄了七部，其中三部早已被毀，原在熱河、奉天的兩部在抗戰開始後己陷敵手。余留的二部，原在北京故宮文淵閣的壹部巳遷四川，原在杭州文瀾閣的壹部，36000多冊，在八?壹三淞滬抗戰前由浙江圖書館裝成140箱運到富陽鄉下存放；後日軍進逼，省圖書館想把它運至建德，但省裏不發經費，竺可楨得知後馬上派校車幫忙運到建德。以後省圖書館又把它運到龍泉鄉下。浙大遷到江西後，竺校長為四庫全書的安全耽心，認為在龍泉也不安全，特地致電教育部，指出四庫全書應及早遷到內地，並表示浙大願意派人協助。教育部復電同意竺校長的意見，準備遷到貴陽，要求浙大協助遷運。竺校長即指派壹位教師回到浙江，與有關部門商議，中經周折，終於會同浙江圖書館啟運出省，途經五省，歷程2500余公裏，全部安全運抵貴陽附近的地母洞存放。浙大遷到貴州後，竺校長幾次到地母洞了解情況，並對保管工作中的問題提出改進意見，使這壹文化瑰寶得以安全渡過抗戰時朋，戰後運回杭州。
1938年6月26日，浙江大學有壹批畢業生即將走向社會。這也是浙大在抗戰中的第壹批畢業生。竺校長在當天舉行的畢業典禮上，發表了大學畢業生應有的認識與努力的富有哲理、充滿激情的講活。他勉勵學生要日日新，又日新，以天下為己任，使中華成為不可滅亡的民族。他希望同學們不求地位之高，不謀報酬之厚，不憚地方的遙遠和困苦，凡是吾人份內所應該做的事就得去做。竺校長在結束講活時說：現在救國的責任，已在諸君身上，希望大家能擔當起來。
西遷途中，壹些同學滿懷悲憤投筆從戎，上前線殺日寇。竺可楨對同學們的愛國熱情大加贊賞，以戰國時代趙氏孤兒的故事教導同學：當今臨敵之際，年輕人有兩種途徑可以報國，壹是赴前線殺敵，此舉需要勇氣和膽量，如程嬰所為；壹是在校刻苦學習，以後從事建設工作，此舉需要毅力與恒心，如公孫杵臼所為。竺校長的講演，對學生們是鼓勵和鞭策。