負責政務工作，負責文電、會議、機要、檔案、保密、接待等機關日常工作；承辦宣傳、信息、監督、政務公開、安全和後勤服務；負責起草重要文件、目標管理、辦理建議和提案、辦公自動化等。
(二)組織人事部門(黨委)
負責全市糧食系統基層黨組織建設、思想政治工作、人事管理和機構編制工作；協助黨委做好幹部的日常管理和教育培訓工作；負責理論宣傳工作；負責機關黨群工作。
(3)信息控制辦公室
負責全市糧食信息網的建設、收集、整理和發布，指導企業經營和農民種植結構調整；負責組織實施全市糧油流通統計工作；研究提出糧食宏觀調控、總量平衡、糧食流通中長期規劃、市級儲備糧儲存和動用的建議；研究提出市級儲備糧的規模、總體布局和購銷計劃；承擔糧油監測、預警和應急相關工作；組織供應口糧、城鎮居民和水庫移民安置區、災區和貧困地區所需的政策性糧食。指導和協調最低收購價糧食、糧食產銷合作等政策性糧食的購銷。
(4)政策法規部(信訪辦)
研究提出全市糧食流通體制改革方案並組織實施；研究提出現代糧食流通產業發展戰略建議；對糧食最低收購價原則提出建議；擬訂全市糧食市場體系建設發展規劃，負責全市糧食收購資格的審核管理和驗證；制定糧食檢驗制度和相關技術規範；組織起草全市糧食流通立法和市級儲備糧管理及相關政策的規範性文件草案，承辦相關行政復議和行政訴訟；負責全市糧油行業安全生產、消防工作，負責信訪工作。
(5)監督檢查辦公室
制定全市糧食流通監督檢查的制度和措施並組織實施；監督檢查《糧食流通管理條例》和國家有關政策法規的執行情況；監督檢查全社會糧食收購、銷售、儲存、運輸、質量標準和國家糧食流通統計制度的執行情況；監督檢查地方儲備糧的計劃、數量、質量和技術規範的執行情況；組織指導對政策性糧食購銷活動的監督檢查；承擔全市糧食庫存檢查工作。
(6)財務審計辦公室
負責管理全市糧油政策性補貼和糧食專項資金；編制全市糧食會計報表和財務分析；組織實施國家有關財務會計、稅收和信貸政策；參與國家政策性糧食業務收購資金的使用、管理和監督；參與糧食財務損失的清理、消化和管理，參與糧食風險基金的計算、管理和監督使用；負責指導全市糧食系統扭虧增盈和會計基礎工作；負責局機關和直屬單位的部門預算及相關財務會計管理；負責局機關及直屬事業單位政府采購、國有資產管理和內部審計工作。對市糧食局直屬企事業單位國有資產進行監管。
(7)流通與產業發展司
審定市級儲備糧油輪換計劃；指導糧油的科學管理；審批市級儲備糧代儲企業的資格；負責申報中央儲備糧和省級儲備糧代儲企業的資格；制定全市糧油儲運儲備管理制度並組織實施；擬定全市糧食流通基礎設施、糧油倉儲設施和糧油加工業的投資和發展規劃；指導全市糧食流通、糧油倉儲和糧油加工行業基礎設施的建設和管理。指導全市糧食產業化經營、多種經營、連鎖經營、“三產”發展、主食廚房工程、放心糧油工程、農村社會化服務體系建設。負責全市糧食企業改革；負責全市糧食流通市場體系建設和科技進步、技術創新、產業升級；負責培育和發展糧油食品產業化市級龍頭企業；引導行業利用外資、引進技術設備和對外經濟技術合作與交流；負責糧食行業協會、經濟學會等協會的管理。
(八)離退休幹部辦公室
負責機關離退休幹部工作，指導直屬單位離退休幹部工作。
(九)紀檢(監察)機構
根據相關規定設置。