如果轉讓價格較低，稅務局會按照市場價格重新核定股權轉讓收入，計算稅款。
法律依據:《中華人民共和國國家稅務總局關於發布的公告》(中華人民共和國國家稅務總局公告第67號，2014)規定，個人轉讓其股權時，股權轉讓所得扣除股權原值和合理費用後的余額，作為應納稅所得額，按“財產轉讓所得”繳納個人所得稅。合理費用是指股權轉讓時按照規定支付的相關稅費。
第十壹條有下列情形之壹的，主管稅務機關可以核定股權轉讓收入:申報的股權轉讓收入明顯偏低且無正當理由的。
第十二條有下列情形之壹的，應當認定為股權轉讓收入明顯偏低。
擴展數據:
企業產權與股權的關系有以下幾點:
1.股權和法人財產權同時產生，都是投資的法律後果。
2.壹般來說，股權決定法人的產權，但也有特殊和例外。因為股東大會是企業法人的權利機構，它做出的決議決定了法人必須執行。這些決議和決定是投資者行使股權的集中體現。所以壹般情況下，股權決定法人的產權。
股權是企業產權的核心和靈魂。但法人在承擔民事責任時，不需要股東大會的批準和認可。這是公司產權不受股權支配的例外。這也是法人制度的必然要求。
3.某種意義上，股權也可以說是法人的控制權。收購企業法人100%股權，就獲得了企業法人100%的控制權。股權在國家手裏，企業法人最終會被國家控制。
股權在公民手裏，企業法人最終會被公民控制；股權在母公司手裏，企業法人最終會被母公司控制。這是古今中外不爭的社會現實。
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