安徽中國徽州文化博物館的基本陳列為《徽州人與徽州文化》，分為：走進徽州、天下徽商、禮儀徽州、徽州建築、徽州藝術、徽州科技六個部分；內容有：新安大好山水、徽州與徽州人、明清徽商、徽州女人、東南鄒魯、程朱闕裏、徽州宗族、新安醫學、科技之星、文房瑰寶、新安畫派、徽派版畫、徽派篆刻、徽州村落、徽州民居、徽州三雕等。
建館以來，館內相繼舉辦過《館藏孤雁展》、《館藏古陶瓷展》、《徽州文房四寶展》、《徽州明清容像展》、《名人書畫展》、《黃賓虹、汪采白書畫展》、《古代畫家筆下的黃山畫展》、《黃山市中***黨史資料展》、《徽州雕刻藝術展》、《兵馬俑展》、《館藏楹聯墨跡展》、《黃山市館藏文物精品展》、《徽州契約文書展》等，多方面展示了館藏文物濃厚的地方特色。也曾經舉辦過《毛澤東誕辰壹百周年圖片展》、《紀念抗日戰爭勝利四十周年黨史展》、《太平湖恐龍化石展》、《“新四軍抗日烽火”專題展》；配合黃山國際旅遊節舉辦過《黃山市二十年成就展》和《臺北故宮博物館院長江兆申先生書畫展》以及《黃山市書、畫家作品展》、《大風堂弟子遊三輝書畫展》、《古近代畫展》、《新安畫派書畫展》、《張啟聰攝影展》、《黃山山中人——黃賓虹書畫精品展》、《黃山市博物館藏黃士陵書畫展》和《徽派三雕藝術陳列》等文物專題展覽。