《武經七書》的版本流傳經受了坎坷的經歷。從史書和書目記載看，《武經七書》是有北宋刊本的。元豐三年就雕版印行過。清代《麗宋樓藏書誌》還載有北宋刊本，可惜今不可見。現在所能見到的最早的刊本是南宋孝宗、光宗年間的刊本，原書藏在日本靜嘉堂文庫，國內通行的是這個版本的影印本。現在所能見到的最早的抄本是北京圖書館善本部藏的影宋抄本《武經七書》二十五卷(縮微膠卷，原書藏臺灣省)，著錄為宋朱服等校定，張蓉鏡等跋。此外還有宋刻元明遞修本、明初刻本、明嘉靖三十壹年陜蕃刻本、明國子監刻本等。註釋本《武經七書直解》曾在明代盛行壹時，現在尚能見到的有明成化二十二年趙英刊本、明萬歷九年莫與齋刊本、明崇禎十年翁洪業刊本、明刊本等。然而到清乾隆修《四庫全書》時，竟未收錄全書，只收《三略直解》壹種。其他六種及至民國才得以從丁氏八千卷樓舊藏中發現出來，影印、排印行世。明清以來各種註釋本相繼刻印，流傳至今的也較多，如明萬歷乙未年籌勝堂刻周國雍註本、明天啟四年李逢申刻李清集註本、明天啟元年茅震東刻王守仁評註本、明萬歷三十二年陳汝忠弘錫堂刻何守法音註本、明末東壁齋刻李贄參同本、明萬歷十六年刻趙光裕標題正義本、明末金陵唐錦池刻標題正義本、明末金閭十乘樓刻陳玖學註釋本、明王立賢刻黃榜重編考註本、明末刻謝弘儀輯註本、明崇禎九年繹世堂刻沈應明輯註本、明崇禎十年吳氏富酉堂刻黃華暢類註本、明龔紹山刻陳元素輯註本、明崇禎刻孫履恒裒谷子商騭本、明崇禎刻沈際飛合箋本、明崇禎九年刻黃獻臣開宗本、明崇禎五聚堂刻開宗本、清康熙沈定遠訂正開宗本、清康熙四十八年寶旭齋刻魯經會解本、清刊(清康熙三十九年刊、四十四年三畏堂光啟堂合刊、康熙年間懷山園刊、光緒二年古經閣刊、輝發索綽氏嶺南校刊)朱墉匯解本、日本寬文辛醜年(清順治十八年)日本嵩山堂刻張居正輯註本、清康熙賜書堂刻丁洪章全解本等。