小微企業發展中存在的主要問題有:
1.由於國際國內各種原因，主要是國內經濟社會中的非理性因素，我國小微企業遇到了壹系列嚴重影響其生存發展的困難，可以概括為“兩高困境”:成本高、稅負高；就業難，融資難。
2.小微企業與大型企業成熟度相比，在管理體制、人才配置、資金等方面差距較大，成為企業應用信息化的主要障礙。
3.小企業資源有限，缺乏專業的會計人員，職責分工不明確。
對小微企業發展的建議:
1.小微企業的經營目的是利潤最大化，而利潤不僅是企業經營發展的基本保證，也是企業經營業績的重要指標，這就決定了企業為了獲得更高的利潤會想盡辦法降低成本。在各種納稅方案中，企業稅務會計通過事先籌劃，對采購、生產經營、利潤分配等財務活動進行合理決策，利用國家法律法規進行積極的稅務籌劃，既保證了企業履行利稅義務，增加“造血”能力，減輕稅負，又提高了企業的稅後利潤，實現了企業的持續健康發展。
2.對於小微企業來說，稅收管理是企業管理中非常重要的壹部分。隨著市場經濟的規範和完善，稅收管理在企業競爭中的作用越來越重要。
3.納稅評估模型是納稅人申報信息生成涉稅指標的基礎，是實現行業指標和涉稅指標有機結合、相互制約的特定行業數據模型。通過行業代表性企業的生產工藝、生產流程和經營特點，計算出單位產品能耗、輔助材料消耗、計件工資等指標參數，再運用投入產出法、關鍵成分控制法、單位產品能耗計算法、計件工資控制法等方法，計算出產品產量或銷售額的線性公式或表格，從而分析企業的生產經營規律和對各種因素的依賴關系，進行全面準確的科學分析和行業指標監測。
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