檢察機關在審查起訴階段，依法告知了被告人劉菊生依法享有的訴訟權利，依法訊問了被告人，聽取了辯護人意見。鹹寧市人民檢察院起訴指控：被告人劉菊生在擔任隨州市委常委、政法委書記、公安局局長，武漢市公安局黨委副書記、常務副局長等職務期間，利用職務上的便利，單獨或夥同他人非法收受財物，數額特別巨大；身為司法工作人員，接受他人請托，對明知是有罪的人而故意包庇不使他受追訴，情節嚴重；身為國家機關工作人員，濫用職權，致使公***財產造成重大損失；財產、支出明顯超過合法收入，其本人對差額巨大的財產不能說明來源，依法應當以受賄罪、徇私枉法罪、濫用職權罪、巨額財產來源不明罪追究其刑事責任。