二、 教學設施建設
1． 投資400萬元的電子電工實訓中心，2001年7月建成。
2． 投資200萬元以上的上海市重點專業實訓項目：岸邊裝卸橋電控與操縱仿真實訓系統，2001年11月建成，使“機電設備安裝與維修”專業成為上海市中職重點專業。
3． 投資185萬元的開放式機房，2003年底建成。
交通部於1999年3月將上海港灣學校成建制劃歸上海海運學院，成立了上海海運學院東校區，包括上海海運學院繼續教育學院（原成人教育學院）、上海船員培訓中心、上海港灣學校、上海海運學院高等技術學院港灣教學區，實行三塊牌子壹套班子的管理體制。根據總院統壹部署，2001年12月29日，三塊牌子調整為由上海海運學院繼續教育學院、上海海運學院高等技術學院、上海港灣學校組成，仍舊實行壹套班子的管理體制。承擔著成人高等教育、高等職業技術教育、崗位培訓與繼續教育、高級船員培訓、普通中等專業教育等任務。
上海海運學院成人教育由上海海運學院繼續教育學院實施歸口管理，是成人高等學歷教育和非學歷教育管理機構，又是辦學實體。學院下設船員培訓部、函授夜大部、繼續教育部、項目開發部等教學管理部門。船員培訓部（上海船員培訓中心辦公室）負責各類船員的國家港監適任證書的考證培訓和特殊培訓；繼續教育部負責交通系統高、中層次管理幹部和技術幹部的崗位培訓和繼續教育以及面向上海及浦東的各類技術培訓；函授夜大部負責開展成人高等學歷教育、遠距離非學歷教育和專業證書培訓。項目開發部目前負責水上專業成人高職等項目的管理與開發。學院有獨立的教學辦公樓、學生宿舍、計算機房、語音室、食堂等教學生活設施，還有壹整套行政、教材、總務、財務、圖書資料等服務及管理系統，2000年年底，原址嶗山西路500號校區整體拆除，船員培訓及夜大函授辦學主要搬遷至沈家弄738號，繼續教育部在浦東大道2629號。
上海海運學院高等職業技術學院成立於1998年，學院目前分兩個教學區，分別位於浦東北路1010號（稱東溝校區）和浦東大道2600號（稱港灣校區）。東溝校區辦學在原上海市第二幼兒師範學校校址，由上海海運學院和浦東新區社會發展局***建。校區占地40畝，建築面積1.5萬平方米；為解決學生住宿，另租地19畝，學生宿舍建築面積0.5萬平方米。港灣校區原系上海港灣學校校址，1999年成建制劃歸海運學院，作為高等技術學院的壹個校區，開始招收高職生。截止2002年底，高職在校生達2699人，為更好培養動手能力強的應用型高級技術人才，學院開辟了“上海理光”、“上海柯達”、“上海西門子”、“上海貝爾”、“飛利浦”、“上海索廣影像”、“上海港機廠”、“外高橋集裝箱碼頭”、“金貿大廈”等作為學生校外實習實訓基地的企業達40多家。
上海港灣學校創建於1959年9月，是壹所全日制綜合性的中等專業學校，1980年與1984年均被定為國家級重點中專，1999年通過了國家級重點中專評估的復查認定。1998年5月與浦東新區社會發展局簽訂協議，成立***建委員會。1999年3月份上海港灣學校成建制劃歸上海海運學院。學校占地面積49319平方米，建築面積36522平方米，藏書量達15萬冊。為了適應改革開放和經濟發展的需要，學校分別在上海寶山、江蘇靖江、山東煙臺及上海三航局康橋校區等成立了分部或者辦學點，並在上海港機廠等企事業單位設有實訓基地。學校建立了質量管理體系，恪守“重素質，重能力，重創新，發揚港航特色，培養高質量的應用型職業技術人才”的質量方針，多年來為港航企業培養了大批有用之才。