在B CITY住著壹位科學狂人———香椿博士。他為了為自己發明的弓雖1號找靶子，發明了天真無邪且力量強大的機器人靶子壹號（也就是核桃），沒想到核桃把自己的遙控器吞掉，還把博士心愛的機器人打敗了！從此，科學狂人和失控機器人間就經常發生戰爭。
第二期時，工作室來了壹個急於與博士結婚的暗戀博士的女學生———蘋果，博士對她並無好感，但是~~她卻能馴服核桃！博士就讓她來工作室工作。
B CITY發生了襲擊案件，犯人———是壹只狗……被襲擊後的人會長出壹條尾巴……蘋果被襲擊後核桃訓服了狗仔，卻在它腦子裏發現了壹張尋寶圖！
另外壹邊狗的原主人尼古拉斯也在尋找寶物——上古魔法書（其實是想醫治好會笑不停的毛病）博士卻誤會他有什麽陰謀……
誤會引發的尋寶之旅就這樣開始啦！
博士壹行人得到多方指引，終於到了修煉之島……不過，在到島之前，有壹個人告訴他們這其實是壹個吸引魔法師的陰謀……博士他們就義不容辭地想捅破這個陰謀。上島以後，壹個沒有存在感的東東叫他們收集8個物品，就可以得到見到“女王”上古魔法書。不過，好像有壹個人和壹只蛤蟆在跟蹤他們。
另外，尼古拉斯那邊就不像博士他們那麽幸運，魔法卷軸被面具人和壹只蛤蟆奪走不說，還迫不得已地吸走了蜥蜴和法老，變得超醜而且身體還被別人控制。在法老的控制下，還吸收了龍以及很多奇怪的野獸……以及在大結局裏幹脆被打出體外。(雷某人：真是夠慘的)
現在鏡頭轉向博士壹邊，蒙面人居然~~~~~~~~`是個橙發帥哥~~他告訴博士女王其實是他母親，可後來不慎被潘多拉女巫附身，青蛙其實是他的老師，還要求加入博士的隊伍！
而女巫已經知道了維塔的行蹤！！！
尼古拉斯也追蹤維塔！！！
博士壹行人也在向女巫的高塔前進……