會計信息失真嚴重
在審計過程中，我們可以發現有些企業在審計過程中，在會計、統計計算期末。按不同報送對象報出兩套或者兩套以上數據不同的會計報表和統計報表，且各有各的用途，這就使得會計信息失去了可靠性、嚴肅性和可用性，會計信息失真主要與監督問題、企業生存需要、個人利益、迎合上司和逃稅避稅等現象有關，這些問題使得企業會計資料的可信賴程度大大降低，使審計風險大大增強，導致不良資產審計不符合事實，存在諸多不確定因素，影響審計不良資產的結果。
資產界定受制約
審計自身無法控制外界的諸多因素，在審計不良資產過程中，很多情況下都需要其他部門的配合協作，但由於很多條件的限制，諸如企業商用信用程度不佳，使得審計方式並不能得到有效的使用，這就使得界定有些資產是否優良有很大的不確定性，給審計過程帶來了壹些困難。
不良資產自身不確定性
對不良資產本身的界定目前還存在諸多不確定，有些認定為不良資產的資產，在環境或者經營方式發生改變後，我們也無法否認轉變成良性資產的可能，不良資產的動態變化使得審計不良資產存在不同種可能性，這就影響了審計結果的權威性，不良資產審計中的某些設定不被企業接受，使不良資產審計過程困難重重。
缺乏政策依據
不得不提到的就是政策問題，現今會計政策還不完善，在某些方面考慮到國家稅收方面的原因，不允許企業對可能出現的不良資產進行穩健的會計處理，從而使得企業不良資產逐漸累積，而且審計不良資產過程中由於缺乏政策依據導致合法性受到質疑，這也是審計不良資產的壹大難點。
從目前的情況下，企業審計不良資產還存在諸多困難，在審計過程中，不管是內部因素還是外部因素，都需要我們迫切解決，不良資產的審計可以讓我們更加的了解企業的不良資產現狀，側面反映了企業經營現狀，及時發現問題並且有效的解決這對於企業的發展乃至社會經濟的發展都有些很重要的作用，因此審計不良資產是每個企業必須攻克的難題之壹，畢竟想要長久發展，審計不良資產有著不可磨滅的作用。