第壹種依申請扣留，是指知識產權權利人發現侵權貨物即將進出口，在有充分侵權證據和擔保的情況下，請求海關扣留侵權貨物。。
第二種主動發現並依職權通知權利人的程序，是指海關發現貨物侵犯他人知識產權的(知識產權必須先向海關備案)，會主動通知權利人，然後由權利人決定是否申請扣留。這種方式的啟動必須有壹個前提，那就是知識產權已經在海關備案。海關在貨物稱重監督檢查中發現侵權貨物，通知權利人詢問權利人是否申請扣押。海關不會關註未備案的知識產權。
收到海關查封通知書後，及時配合海關調查，提出不侵權的書面意見並附相關書面證據。這些文件可以包括不侵權的理由、知識產權的權屬文件、授權文件、不侵權的技術分析等。