廣州市婦聯設有辦公室、組織聯絡部、宣傳部、權益部、發展部、研究室、兒童部。廣州市政府的議事協調機構廣州市婦女兒童工作委員會辦公室也設在市婦聯。
辦公室
負責市婦聯的內外協調、政務服務、事務管理工作；負責重大會議的組織工作和接待工作；負責市婦聯文件、材料的下發、報送的審核工作；負責領導布置任務的督辦工作；承辦文電處理、秘書事務、檔案、機要、保密等工作；負責網站維護和管理；負責機關財務、資產、物業、審計、安全保衛及基本建設等管理服務工作。
組織聯絡部
負責基層婦聯組織建設工作；負責團體會員組織管理工作；負責機關幹部和直屬單位領導幹部的管理；負責機構編制、職稱、工資、調配、出國政審、招聘錄用、統計、人事檔案以及公費醫療、離退休幹部管理服務等工作；配合有關部門做好培養選拔女幹部工作；指導和協調婦聯系統幹部教育培訓規劃的編訂和實施；聯系社會各界婦女組織；負責與港澳臺地區及海外僑胞婦女的聯誼工作；負責外事接待工作；負責紀檢工作；負責指導聯系廣州市總工會女職工委員會、市女領導幹部聯誼會、市女知識分子聯誼會工作；負責機關黨委工作；負責計生工作。
宣傳部
宣傳黨的路線、方針、政策，宣傳馬克思主義婦女觀和男女平等思想，宣傳婦女和婦聯工作；有針對性地開展婦女思想教育工作；組織婦女開展“羊城巾幗獻才建功”、“雙學雙比”活動，提高婦女的文化科技素質和適應市場經濟發展的能力；配合有關部門開展群眾性的精神文明創建活動，指導和實施“五好文明家庭”創建活動和家庭文化建設；組織“三八”紅旗手的評選表彰工作；負責指導聯系市女企業家協會、廣州女子書畫會工作。
權益部
負責參與有關維護婦女兒童權益法規、規章的擬訂和有關普法工作；指導、推動各級婦聯依法維護婦女兒童權益工作；推動婦女群眾自治組織的建立與發展；負責處理群眾來信來訪，參與對重大典型信訪案件專項調查，為受害婦女提供法律援助和社會服務；開展社區維護婦女兒童權益工作；負責指導聯系市律師協會女律師委員會、市女醫師協會工作。
發展部
動員和組織婦女參與經濟建設和社會事務，開發婦女人力資源；指導區、縣級市婦聯組織建陣地辦實體工作，管理和拓展我市婦女兒童活動陣地和婦聯系統經濟實體；動員和組織婦女參與扶貧工作。
研究室
負責本會重大課題的調查研究，開展有中國特色社會主義婦女工作理論的研究；組織、協調、指導本會各部室和各級婦聯開展婦女、兒童方面的重大問題的調查研究工作；負責本會重要文件和文稿的起草工作；負責市婦聯系統婦女工作信息的收集、反饋和報送工作；負責內部刊物《廣州婦聯》的編輯和發放工作；負責指導聯系廣州婦女學研究會工作。
兒童部
負責參與有關保護兒童的法規、規章的擬訂；開展女童工作，促進女童身心發展；開展兒童相關工作；負責家庭教育工作的協調與服務；參與推進校外教育和開展社區兒童工作，協調、推動全社會為兒童的健康成長創造良好的社會環境；負責廣州市婦女兒童工作委員會辦公室日常工作；負責指導聯系市家庭教育研究促進會、市兒童福利會工作。
廣州市婦女兒童工作委員會辦公室
廣州市婦女兒童工作委員會由市政府副市長擔任主任。其主要任務是制定和落實《廣州市婦女發展規劃》和《廣州市兒童發展規劃》，促進廣州婦女兒童發展和進步。廣州市婦女兒童工作委員會辦公室設在婦聯，主要是統籌、協調婦女兒童工作委員會各成員單位開展工作。