1、網上申請。在“高新技術企業認定管理工作網”註冊登記，向認定機構提出認定申請；
2、網上申請通過以後，企業要向地方科技局提交相關申請的書面材料；
3、認定機構收到企業申請材料後，組織不少於五名專家進行評審；
4、對申請企業申報材料進行綜合審查，確定認定高新技術企業名單；
5、經認定報備的企業名單，經過公示10個工作日。無異議的，予以備案，認定時間以公示時間為準，核發證書編號；
6、由認定機構向企業頒發統壹印制的高新技術企業證書。
高新區科技有限公司註冊條件具體如下：
（1）有滿足企業公司進行登記工作條件的投資者，且股東人數符合國家法定要求；
（2）公司名稱和公司章程符合有關規定。 本章程由全體股東簽字（或蓋章）；
（3）有符合註冊規定的營業處所（該等處所的性質必須為商業性質） ;
（4）對科技公司經營範圍中法律、行政法規及有關部門規定必須報經批準的項目，也要及時辦理前置（或後置）審批，取得相應許可。
認定條件：
（1）企業申請認定時須註冊成立壹年以上；
（2）企業通過自主研發、受讓、受贈、並購等方式，獲得對其主要產品（服務）在技術上發揮核心支持作用的知識產權的所有權；
（3）對企業主要產品（服務）發揮核心支持作用的技術屬於《國家重點支持的高新技術領域》規定的範圍；
（4）企業從事研發和相關技術創新活動的科技人員占企業當年職工總數的比例不低於10%；
（5）企業近三個會計年度（實際經營期不滿三年的按實際經營時間計算，下同）的研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例符合如下要求：
a.最近壹年銷售收入小於5000萬元（含）的企業，比例不低於5%；
b.最近壹年銷售收入在5000萬元至2億元（含）的企業，比例不低於4%；
c.最近壹年銷售收入在2億元以上的企業，比例不低於3%。
其中，企業在中國境內發生的研究開發費用總額占全部研究開發費用總額的比例不低於60%；
（6）近壹年高新技術產品（服務）收入占企業同期總收入的比例不低於60%；
（7）企業創新能力評價應達到相應要求；
（8）企業申請認定前壹年內未發生重大安全、重大質量事故或嚴重環境違法行為。
高新技術企業都有什麽優惠政策？
1、所得稅優惠
從發證日期開始，證書有效期內（三年）企業享受15%的所得稅優惠政策。（所得稅率：壹般企業為25%，小型微利企業20%）
2、研發費用稅前加計扣除
企業當年的應納稅所得額中可以抵扣實際發生的研發費用的50%。抵扣有兩種情況：
A.研發費用計入當期損益未形成無形資產的，允許再按期當年研發費用實際發生額的50%，直接抵扣當年的應納稅所得額。
B.研發費用形成無形資產的，按照該無形資產成本的150%在稅前攤銷，攤銷年限壹般不得低於10年。
3、“優先支持”
各類政策扶持資金的申報指南裏，大多都會寫明“優先支持高新技術企業”，比如省、市的科技計劃、企業技術中心認定等。
法律依據：
《2016年高新技術企業認定管理辦法（新版）》
第十壹條
認定為高新技術企業須同時滿足以下條件：
（壹）企業申請認定時須註冊成立壹年以上；
（二）企業通過自主研發、受讓、受贈、並購等方式，獲得對其主要產品（服務）在技術上發揮核心支持作用的知識產權的所有權；
（三）對企業主要產品（服務）發揮核心支持作用的技術屬於《國家重點支持的高新技術領域》規定的範圍；
（四）企業從事研發和相關技術創新活動的科技人員占企業當年職工總數的比例不低於10%；（五）企業近三個會計年度（實際經營期不滿三年的按實際經營時間計算，下同）的研究開發費用總額占同期銷售收入總額的比例符合如下要求：
1. 最近壹年銷售收入小於5,000萬元（含）的企業，比例不低於5%；
2. 最近壹年銷售收入在5,000萬元至2億元（含）的企業，比例不低於4%；
3. 最近壹年銷售收入在2億元以上的企業，比例不低於3%。 其中，企業在中國境內發生的研究開發費用總額占全部研究開發費用總額的比例不低於60%；
（六）近壹年高新技術產品（服務）收入占企業同期總收入的比例不低於60%
（七）企業創新能力評價應達到相應要求；
（八）企業申請認定前壹年內未發生重大安全、重大質量事故或嚴重環境違法行為。