憑借領先的技術和創新能力，公司是多項國家級項目承擔單位與國家級技術中心：獨立承擔了“新型佐劑CpG ODN乙肝疫苗”等三項國家科技部“863”高科技攻關課題，是國家發改委“b型流感嗜血桿菌結合疫苗”與“凍幹A C群腦膜炎多糖結合疫苗”兩項國家高技術產業化示範工程基地，是國家發改委“昆明國家生物產業基地-疫苗生產中試中心”和國家科技部、衛生部重大傳染病防治專項“細菌多糖結合疫苗技術平臺中心”；是國家科技部“國際科技合作基地”；是雲南省疫苗工程技術研究中心。
公司在研發上始終堅持“填補國內疫苗空白、實現疫苗產業升級”的研發戰略，將創新作為公司最為重要的核心競爭力要素來打造。研發費用已連續多年年投入超過千萬元，確保了技術研發和成果的推廣應用工作順利進行。成立9年來通過自主研發，成功開發了壹系列極具市場價值的疫苗產品。目前，公司已獲得生產批準文號並上市銷售的產品有“b型流感嗜血桿菌結合疫苗”、“凍幹A、C群腦膜炎球菌多糖結合疫苗”2個產品；已完成臨床研究總結和試生產、正在申請生產批件的產品有“凍幹A C W135 Y群流腦多糖疫苗”等2個；已完成臨床研究總結、正在建設GMP生產車間的產品有“無細胞百白破聯合疫苗”等2個；正在進行臨床研究的產品有1個；已獲臨床研究受理註冊的疫苗有5個。另在研的疫苗產品還有十幾項，其中大部分產品是替代國內市場的“升級換代產品”或國外已廣泛使用而國內尚未國產化的“填補國內空白產品”。在疫苗研制和質控工藝等方面，公司已獲得6項發明專利證書。
2007年9月，公司第壹個自主研發的產品“b型流感嗜血桿菌結合疫苗”獲得SFDA批準，在玉溪疫苗生產基地成功投產上市，公司實現了由壹個研究機構發展成為集研產銷壹體化的具有完整產業鏈的新興疫苗企業的歷史性轉變。2009年9月，公司具有自主知識產權的第二個產品“凍幹A、C群腦膜炎球菌多糖結合疫苗”又獲批準上市銷售。未來幾年，公司將向市場不斷推出結構優良、極具市場前景的系列疫苗產品。