（壹）1999年9月30日
10:35該核燃料加工廠的γ輻射監測器測出異常數值，發出報警鈴聲，全體人員退到廠區廣場處避難。
10:43該廠向東海村消防隊119電話報警，但是報警人沒有告知已發生了核輻射事故。（10:44救護車出動）
10:45廣場處的γ輻射劑量上升，避難人員又退避到廠正門處。
10:46救護車到達現場，急救隊員用擔架擡著重傷者並與現場其它人員撒離現場。
10:55核燃料加工廠成立事故對策指揮部
11:19壹輛消防車（隨車3名消防隊員）到達現場，經使用袖珍式輻射測量儀偵察測得劑量為9μSv。
11:49救護車將3名傷員送往國內水戶醫院搶救，第二批消防車到達，成立搶險指揮部，由於現場輻射劑量水平高，未能進入現場。
11:51搶救隊員用袖珍式輻射測量儀測定，數值為14μSv。
11:55原子能管理機構2名官員到達現場。
12:00現場輻射劑量為100μSv。
12:10警察機關成立原子能事故對策指揮部。
12:30東海村利用防災無線通訊系統向居民發出進入室內躲避的通告。
12:40水戶醫院因沒有無菌室，傷員需轉送千葉縣放射線醫學綜合研究所住院治療。
13:02申請使用茨城縣防災直升飛機運送傷員。
13:32事故對策指揮部根據現場判斷無火災可能，第壹批消防隊撒離現場。
14:15直升飛機起飛（14:45直升機到達千葉市直升機航空站）。
15:23傷員到達千葉縣放射線醫學綜合研究所。
15:30東海村，距事故現場350m以內的居民開始疏散撒離。
16:00茨城縣成立原子能災害對策指揮部。
21:02日本首相官邸召開政府對策指揮部第壹次會議。
22:28日本國家鐵路的常磐線在水戶站壹日立站之間暫停運行。
22:30要求距現場10km以內的居民在室內避難。
1999年10月1日
1:00距事故現場1km範圍內實行交通管制。
1:18請示派遺陸上自衛隊（人員約700名，車輛約130輛）
1:30要求距事故現場半徑為10km的所有學校（約134所）暫時休假，並對周圍1km範圍的農作物、水源等進行放射性汙染檢測調查。
2:35開始從事故現場沈澱槽中抽出含有放射性的液料（6:04抽完）。
5:42請示派遺航空自衛隊與海上自衛隊支援。
6:15確認設施內臨界反應停止。
6:30現場各監測點，測得中子輻射劑量均已在限值以下。
8:19向沈澱槽中註入硼酸水以進壹步吸收中子輻射。
9:20日本原子能安全委員會發出臨界事故狀態解除的公告。
16:30發出解除室內避難的公告。
1999年10月2日20時左右，避難居民全部返回原住處。