第壹階段:計劃和準備
企業高層應該從企業戰略的角度考慮BPR。過去的流程需要從根本上改變嗎？企業信息化的目標是什麽？只有對這些問題有了清晰的認識，才能有序的推進後續的流程改造。在此基礎上，企業高層要確定哪些流程需要重組，制定明確的流程再造目標，成立BPR項目領導小組，制定詳細的項目規劃。
第二階段:過程診斷
對現有流程和子流程進行建模和分析，診斷現有流程，發現流程中的瓶頸，並為業務流程再造定義基準。雖然有專家認為BPR不應該拘泥於現行流程，但在實際工作中，忠實地描述現有流程，並在此基礎上找到流程再造的突破口，才是最直接的方法。
第三階段:流程設計和優化
在分析原有流程的基礎上，設計新的流程原型，設計支持新流程的IT架構。
第四階段:批準
重新設計的企業流程是否實現了最高管理層的戰略目標需要通過審核過程來保證。
第五階段:具體實現
在這個階段，真正的重組開始了。
第六階段:過程評估和管理
業務流程再造後，可以根據項目開始時設定的目標對當前流程進行評估，看新流程是否達到了預期目標。另外，壹個BPR項目的實施並不意味著公司改革任務的完成，整個企業的績效需要持續改進才能實現。這種持續改進實際上是對過程的持續分析和改變。