轉基因食品的反對者涉及廣泛的利益群體，從綠色和平組織到農民協會再到基督教會，他們的反對主要集中在三個方面:
轉基因是違背自然的，所以是有害的。支持者反駁說，現在的農作物已經不是原來的品種了，否則人們就應該像吃動物吃的草壹樣吃蔬菜。
至於植物提供的食物在引入具有抗除草劑功能或害蟲中毒功能的基因後，對人體是否安全，支持者強調，到目前為止，沒有任何有資質的研究機構發現轉基因食品對人體健康有害的證據，但其長期影響只能推斷，壹時難以獲得全面的證據來說服人們。
推廣抗除草劑轉基因作物可能會鼓勵農民過度使用除草劑，從而導致壹些非主要作物受到傷害甚至滅絕。許多發展中國家的農民壹直將這類非主要作物視為輔助食品或飼料。美國魚類和野生動物管理局發現，74種植物因除草劑而瀕臨滅絕。
2.環境汙染
轉基因技術可能會造成生物汙染。為了保護自己的知識產權，壹些生物技術公司已經對出售給農民的轉基因種子進行了消毒。印第安納大學生物學副教授瑪莎·克勞奇的研究表明，這種不育基因可能會無意中使其他作物不育。
3.對其他植物品種的危害
具有特殊功能的基因“遷移”到類似的野生植物品系中，使其對除草劑產生抗藥性，難以控制；或者讓害蟲產生抗殺蟲劑的抗體。此外，壹些小生物如果吃了具有殺蟲功能的轉基因植物，可能會滅絕。
支持者指出，農業生產本身就是壹種危害環境的活動，轉基因作物不會比傳統農業對環境造成更大的危害。植物本身具有抗蟲能力，農民可以減少噴灑農藥，有利於環境和生物保護。
擴展數據
優勢
轉基因食品有很多優點:可以提高作物產量，降低生產成本，增強作物對害蟲和病毒的抵抗力，提高農產品的耐貯性，縮短作物發育時間，擺脫四季供應，打破物種界限，不斷培育新物種，生產出對人類健康有益的食品。
劣勢
轉基因食品也有弊端:所謂的增產是在沒有環境影響的情況下獲得的，如果遇到雨雪等自然災害，可能會減產更多。同時，在種植過程中，轉基因作物可能演變成農田雜草；可能通過基因漂移影響其他物種；轉基因食品可能會引起過敏。
百度百科-轉基因食品
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