物流信息系統的應用可以縮短從接受訂貨到發貨的時間、實現庫存適量化、縮減庫存開支、提高搬運作業效率、實現合理運輸、減少運輸成本、提高運輸效率、使接受訂貨和發出訂貨更為省力、提高訂單處理的精度、防止發貨與配送差錯、實時反映物流市場變化並作出即時反應等等，最重要的是通過物流信息系統的應用，能夠實現物流各個環節、各個部門與各企業之間的完美銜接和合作，實現物流資源的合理調配和使用，保證壹體化物流供應鏈管理的完成，達到以客戶為中心、以市場為基礎的物流服務目標。
國內外在物流領域中應用信息系統的結果證實，物流的各個領域都可以通過計算機為基礎的信息系統得到改善，統計證實，應用物流信息系統，常常可使生產率提高10%至15%。