破產清算會計科目的設置應能適應目前的法律、法規和滿足核算的需要。繼（破產法）之後，國務院於1994年發布了國發（94）第59號文件，規定了“企業破產時，企業依法取得的土地使用權……轉讓所得首先用於破產企業的職工安置，安置破產企業職工之後有剩余的，剩余部分與其他破產財產統壹列人破產財產分配方案。”“破產企業的職工住房、學校、托幼園、醫院等福利性設施，原則上不計人破產財產。”1997年財政部制定的《國有企業試行破產有關會計處理問題暫行規定》（以下簡稱《暫行規定》中制定的23個會計科目，並不能完全反映和核算這些事項。如實務中常遇到破產財產壹時無法變現，不得不由清算組借入貨幣資金來支付清算費用，這給清算組做賬出了難題：若在借入款項時借記“現金”科目，貸記“應付款”科目，會造成破產財產和破產債務不實；在支付清算費用時，若借記“清算費用”科目，貸記“現金”科目，則造成了現金紅字，清算組只有不做賬。因此建議：
1.增設抵押資產和投押債務科目，反映、核算破產宣告日六個月以前已成立的合法擔保事項。
2.增設“福利設施資產”和“福利設施資金”科目，核算與反映優惠處置的職工福利設施資產和資金。
3.增設“清算期借人資產”及“清算期應付債務”兩個科目。
4.增設核算實物在企業，而產權不屬企業的代銷、寄銷商品的有關科目。
5.增設核算應付而未付清算費用的有關科目。
6.增設“應付職工安置費”科目。
增設以上破產清算會計科目之後，原來的“土地轉讓收益”科目便可取消，因為土地轉讓收益或作為職工安置費或作破產財產分配，不再是所有者權益了。為此，資產負債表也應作相應調整。
二、破產清算審計
破產清算審計是依法對破產清算會計信息進行再確認的監督過程，因此，只能把法院宣告破產、進入了清算程序的審計項目叫做破產清算審計。破產清算審計的職責是對破產清算的會計信息發表意見，也就是對依法處置破產企業的資產，償還債務發表意見。如聘請註冊會計師參與破產清算，應分清會計責任和審計責任，否則是與獨立審計準則不相符的。
進行破產清算審計，除了常規的財務審計、會計報表審計之外，還有如下幾點值得註意：
1.審查破產宣告日前六個月企業的財務收支，通過實物資產的增減變化、債權債務的處理，看有無隱匿、私分、無償轉讓資產和非正常壓價等違法行為。
2.核對從行業會計科目轉人破產清算會計科目是否與《暫行規定》相符，金額是否正確。
3.應收款在清算期收回的核算是否正確，呆賬壞賬的核銷有無依據，有無法院裁定或財政部門批準。
4.存貨的毀損盤虧的處理有無必要的程序和是否經批準。
5.固定資產的報廢、盤虧、損失是否經批準。
6.資產評估增值（減值）的核算是否正確。
7.抵押資產、福利設施資產、借人資產、取回資產的核算依據是否充分，核算是否正確。
8.破產債權申報的時間限制、數量與賬面有無差異，清算調整的依據是否充足；逾期未申報的是否依法處理。
9.第壹順序破產債務的核算是否合法。
10.清算損益的核算是否正確。
審計發現有以上問題時，書面通知清算組作出雕整，有違法行為的建議委托人移送有關部門處理。在清算組作了會計調整後才出審計報告。
破產清算審計報告，是對破產清算會計認定的破產財產、破產債權總額及清償順序的公證，為債權人討論通過破產財產分配方案提供證據，也是為法院作出民事裁定作參考。出於這樣的用途，審計報告只有無保留意見和否定意見兩種類型，保留意見、拒絕表示意見的報告債權債務各方都是不會接受的，而且否定意見的審計報告很可能造成破產程序的中斷，因此應將查出的問題解決調整後再出報告，不要輕易出具否定意見的報告。審計報告的出具除執行《獨立審計具體準則第7號——審計報告》的規定外，只增加壹個說明段，強調壹下清算的主要數據即可。