魯魯修被卷入新宿事件，遇到了久別7年的朱雀，朱雀現在是作為名譽布裏塔尼亞人的壹等兵。隨後庫洛維斯所謂的“毒氣罐”被打開，裏面竟是壹個綠頭發的少女，朱雀因為拒絕向魯魯修開槍而遭遇射擊，而魯魯修從少女那裏得到了Geass——對對方下達命令對方必須遵守命令的能力。
2 覺醒的白色騎士
魯魯修用Geass奪走騎士侯維萊塔的knighmare指揮扇、華蓮他們戰鬥，追擊部隊節節敗退，這時候被羅伊德所救的朱雀駕駛最新向導兵器lanclot出陣壹下擊潰了抵抗分子們。魯魯修抓住空隙殺死了庫洛維斯並得到了柯內利婭知道母親死亡真相的情報。
3 虛偽的同學
華蓮出現在學校，魯魯修因為使用Geass失敗而遭到華蓮懷疑，而魯魯在浴室（……）裏用錄音電話消除了懷疑，並通過實驗了解了Geass對同壹個人只能用壹次。同時朱雀因被指控是殺害庫洛維斯的兇手而被捕。
4 其名為Zero
通過華蓮，魯魯修帶著假面與抵抗分子幾人見面，自稱zero，然後帶領他們用計救出朱雀。但朱雀說出了自己想要和平，想從內部改變布裏塔尼亞帝國的想法，如果他不回去那些人就會以此為借口欺壓Eleven和名譽布裏塔尼亞人，於是朱雀毫不猶豫地回到了法庭。
5 皇女和魔女
魯魯修回家後竟看到了當時的綠頭發少女，自稱C.C，魯魯修告訴C.C自己要為了失明的妹妹娜娜莉用Geass的能力毀掉現在的世界創造新世界。另壹方面朱雀因證據不足被釋放，遇到了粉色頭發的少女，與她說了自己企望和平世界的想法，後來知道她竟然是布裏塔尼亞第3皇女尤菲米婭。
6 被奪走的假面
朱雀也成為了學園的學生但大家因為他是名譽布裏塔尼亞人而用異樣的眼神看他。魯魯修的zero假面被貓戴走貓在校園裏亂竄（我說……），最後貓將假面掉下，被朱雀抓住，魯魯修向大家表明朱雀是自己的朋友並讓朱雀加入學生會。
7 襲擊柯內利婭
柯內利婭和尤菲米婭兩位皇女是因為原總督庫洛維斯皇子的死而新任的AREA11總督及副總督。柯內利婭為抓zero而設計了和新宿壹樣的場面，魯魯修被引出然後完敗，被C.C救出，並下決心要創造可以與布裏塔尼亞抗衡的強大組織。
8 黑色騎士團
壹些布裏塔尼亞人被日本解放戰線的人作為人質要求與柯內利婭談判，米蕾、夏利、尼娜三個學生會成員和尤菲米婭也在其中，尤菲為了保護尼娜挺身而出。朱雀駕駛lanclot搭救無效。後來所有人被zero救出，zero向世界宣布黑色騎士團的成立以及黑色騎士團的宗旨——正義的使者，站在弱小者的壹邊（其實是意識形態）。
9 REFRAIN
這集介紹了華蓮的家庭——媽媽是日本人當了布裏塔尼亞人的小妾生下的她，哥哥是前任抵抗分子的首領已犧牲。黑色騎士團在攻擊REFRAIN（毒品）制造廠時華蓮發現自己的媽媽也在此吸毒，但也因此了解了媽媽多年忍氣吞聲是為了自己成為布裏塔尼亞人不被欺負。
10 紅蓮起舞
Zero率領黑色其實團在成田連山進行著沒有退路的壹戰，準備就此打垮柯內利婭。華蓮駕駛最新的機型紅蓮二式英勇作戰。
11 成田攻防戰
在副總督尤菲的同意下lanclot出戰，解救了紅蓮二式面前的柯內利婭，zero被逼到絕路，這時候C.C出現用能力讓朱雀想起了關於父親的痛苦往事，lanclot暴走，魯魯修因為觸碰到C.C而進入到她的內心，知道了她的真實名字，並在山洞裏叫了出來。
12 京都來的使者
喜歡魯魯修的女孩夏利約他壹起去聽音樂會。白天zero率黑色騎士團與京都交涉成功、確立了合作關系。而夏利白天去成田認屍，原來夏利的爸爸在成田壹戰中犧牲了。晚上見面時夏利和魯魯在雨中親吻。
13 夏利和槍口
魯魯修參加完夏利爸爸的葬禮回來，心中動搖，但已經走上了修羅之路便沒有退路。維萊塔因被Geass影響過而產生了懷疑，告訴夏利魯魯修可能和黑色騎士團有關系，兩人跟蹤魯魯修。Zero在晚上的作戰中與lanclot沖突而受傷，lanclot又被紅蓮二式纏住，夏利揀了壹把槍對著自己面前暈倒的zero想為爸爸報仇，這時候zero的假面掉了下來露出魯魯熟悉的面容。
14 Geass對Geass
黑色騎士團撤退，魯魯修醒來後發現槍不見了地上有壹灘血跡。夏利回家含淚下下信函後趕往成田，魯魯修因那晚在knighmare上有看到夏利懷疑之下也去往成田，而此時夏利已遇到了擁有可以聽見人心中所想事物的Geass的毛。在成田，魯魯修面對用槍口指著自己的夏利不知所措，原來夏利昨晚為了保護魯魯對也看到了zero真面目的維萊塔開了槍，在毛的誘導下準備和魯魯壹起贖罪。夏利壹槍把魯魯修打倒，許多兩人的照片從魯魯修的衣服裏飛了出來。毛被C.C用火車帶走，夏利倒在魯魯修的懷裏，魯魯修對夏利使用Geass讓她忘記了關於自己的所有記憶（那個地方的插曲和劇情配合在壹起，好淒慘TAT）。
15 喝彩的毛
魯魯修回到學園，夏利已經不認識他了。毛打電話來找C.C.出去，C.C為了魯魯修的身份不被暴露而赴約，身處險境，魯魯修用巧計利用警察抓住了毛。原來C.C11年前與毛訂下同樣的契約，Geass的能力讓他遠離了人群，為此C.C被悲傷的情緒籠罩。在這集的劇情還有日本解放戰線的藤堂被抓、扇救了受槍傷暈倒的維萊塔，她已失憶。
16 被囚的娜哪莉
娜哪莉被毛綁架作為和魯魯修的遊戲，魯魯修和朱雀在循環系統下層找到了娜娜莉，但她的頭頂被安了搖擺炸彈，魯魯修告訴了朱雀哪根是應該剪斷的線然後對自己使用Grass使自己忘記已經告訴了的事，只身去找毛挑戰。堅信人心裏想的壹定是真實的的毛輸了，被朱雀抓住。但毛探測到了朱雀的心裏，原來朱雀為了使日本放棄抵抗戰略減少傷亡而殺死了自己的父親樞木玄武，朱雀顫抖著松了手。毛逃出去，C.C在門口結果了毛。
17 騎士
魯魯修希望有個騎士來壹直保護娜娜莉，他選定了朱雀。傍晚黑色騎士團眾去解救藤堂，又壹次遭到lanclot的阻擊，在四聖劍的攻擊下lanclot的駕駛倉被破壞，朱雀的面容露出，原來壹直以來的白色機甲就是朱雀，魯魯修苦笑。這時尤菲向媒體宣稱自己的騎士確定為朱雀。
18 向樞木朱雀命令
朱雀正式在典禮上被命為騎士，Zero定下作戰要俘虜朱雀和lanclot。Lanclot被引到力場裏無法動彈，zero上前與朱雀交涉。此時朱雀接到了這樣的命令：將往他們所在地發射導彈，朱雀負責拖住zero。尤菲無法撤消命令，獨身前往，希望能因為自己被牽連而撤消導彈。與此同時華蓮奮力沖了過去，zero終於向朱雀下達了Geass命令。整個場地被導彈摧毀了。
19 神之島
Zero、尤菲、朱雀、華蓮四人漂流到了神根島之上。當zero用槍指著尤菲時尤菲溫柔地叫出了魯魯修的名字，兩人尋找食物、看星星，感嘆再也不能回到以前的生活。當華蓮洗澡的時候（又是…）朱雀出現，兩人搏鬥之後也尋找食物、考魚吃，互相爭論人生觀……隨後兩對人與搜尋部隊分別相遇，zero和華蓮奪取了兩架knighmare逃走，原來是會飛還有大炮的新機型gawain。
20 九州戰役
夏利看到了自己曾經寫過的信知道了zero就是魯魯修，對自己關於魯魯的記憶產生懷疑。尼娜見到了壹直傾慕的尤菲米婭。Lanclot加上了飛行功能，但在與聯邦的戰鬥中能源用盡，此時朱雀接到尤菲的表白。Zero提供了新的能源，兩人在九州第壹次聯手，大敗聯邦。
21 學園祭宣言
阿什福特學園祭召開，有很多有趣的活動，還要制作世界第壹的比薩，大家都很開心。尤菲碰上了娜娜莉。為了回到以前的生活，尤菲大膽地在學園祭上宣布神聖布裏塔尼亞帝國承認“日本人”，即將建立布裏塔尼亞人和日本人平等的特區。
22 血染的尤菲
雖然很多的人反對，但皇女已宣布的事情不好收回，日本行政特區的成立典禮召開。會場上zero出現要求與尤菲單獨交談，魯魯修被尤菲的善良與犧牲感動，同意合作成立日本特區，並開玩笑地說“我要是下命令的話誰也不能反抗哦，比如現在我說殺光日本人的話…”而偏偏Geass卻在此時失控了，玩笑變成了Geass指令，尤菲沖出去下令繳殺日本人，會場被鮮血染紅了，魯魯修含淚下令誅殺尤菲。
23 至少和悲傷在壹起
尤菲被zero射殺，親眼目睹了這壹幕的朱雀瘋狂搶回尤菲送往飛船治療。Zero與聯邦結盟，下決心最大程度利用尤菲的死，告訴日本人建立特區完全是尤菲米婭的陷阱，並在會場裏宣布新日本的成立。同時尤菲在朱雀面前安靜地死去，這時神秘的女孩V.V出現告訴朱雀Geass的真相。戰爭全面爆發，魯魯修接到朱雀說自己已被仇恨支配的電話。
24 崩落的舞臺
操作人員受Geass影響解體了應對地震的構造，戰事火熱，zero將阿什福特學園作為司令部，想用黑色騎士團的力量保護娜娜莉，華蓮摘下面罩面對學生會的大家。維萊塔的記憶恢復，打傷扇逃了出來。朱雀駕駛lanclot想要向zero復仇卻又壹次被騙到了力場裏不能動彈。娜娜莉叫學生會成員去救朱雀，只剩自己壹個人房內而被V.V帶走了。將軍達爾頓因Geass而襲擊柯內利婭，柯內利婭受傷。
25 ZERO
向柯內利婭提問，卻還是沒有問出母親被殺的真相，反而得知那天是母親自己減少了守衛人員。C.C忽然說感覺娜哪莉被抓去神根島了，兩人準備趕往時遭到復活的米雷米婭的阻撓，zero把指揮權全權交給了藤堂。羅伊德出陣拯救了lanclot，朱雀駕駛它追往神根島，華蓮駕紅蓮二式尾隨。這邊尼娜為了給尤菲報仇做了危險的武器升到地面，那邊C.C讓魯魯修去救娜哪莉，自己獨自對付米雷米婭，並給了魯魯修最後壹吻。山洞中朱雀用槍打掉了zero的面具，朱雀和華蓮絕望，黑暗中壹聲槍響，震動了娜娜莉弱小的身軀。
R2
1. 魔神蘇醒之日（魔神 が 目覚める 日）
2. 日本獨立計劃（日本 獨立 計劃）
3. 被囚禁的學園（囚われ の 學園）
第四話（反擊的處刑臺）
魯魯修孤身出現在出現場上，利用地形將不理塔尼亞軍陣型徹底打亂，當馬上既要救出所有人質時，羅羅駕駛著文森特孤身突入.....最後壹幕朱雀出現在阿修佛德學院前......
第五話（Knight Of Rouds）
魯魯修從新取得了黑色騎士團的信任..轉阿修佛德學院內朱雀轉到了魯魯修的班級，11區政廳內到來了兩位圓桌騎士分別是第三騎士基諾和第六騎士阿尼亞朱雀把這兩人叫來做援軍準備在歡迎會上試探魯魯修記憶是否恢復.....晚會上魯魯修和朱雀在屋頂相遇朱雀讓魯魯修於11區新總督對話但從電話裏傳來的聲音是........
第六話（太平洋奇襲作戰）
當魯魯修將要暴漏的時候羅羅出現使用geass幫助魯魯修滿了過去，魯魯修在太平洋上奇襲總督護衛艦這把將娜娜莉奪回，當即將成功是吉爾福的率領近衛隊前來援助，就連發現事情不對的朱雀也帶領兩位圓桌騎士前來支援......在旗艦內娜娜莉對zero說出了自己真正的願望......
第七話（被舍棄的假面）
計劃失敗後的魯魯修為了娜娜莉的理想決定舍棄黑色騎士團....娜娜莉在繼任儀式上是說出了想要重建特去日本的想法......當黑色騎士團即將全滅是魯魯修重拾那以被遺棄的假面並卻決定黑色騎士團全體加入特區日本.
第八話（百萬的奇跡）
在加入特區前zero和朱雀他們進行密談準備動用100萬人加入要求是放過自己.....轉會場上煙霧彌漫散去後會場上的100萬人全部......
第九話（朱禁城的新娘）
zero帶著100萬人逃亡到中華聯邦提供的蓬萊島上，這是傳來了中華聯邦的天子和不理塔尼亞大皇子聯姻的消息....婚禮上星刻前來阻止婚禮的進行中途zero出現.....
第十話（神虎閃耀之刻）
zero成功奪取天子後撤退的路上遇到到了星刻駕駛的神虎，紅蓮與之交戰中電車電力用盡被俘....zero遭星刻追擊退入帝天八十八陵，這是大宦官對星刻的部隊開火.....
第十壹話（思念的力量）
當星刻面臨絕望的時刻魯魯修回應了星刻想要就天子的願望使用蜃氣樓就閑了星刻，這是整個中華聯邦卻出現了叛亂....
第十二話（Love Attack）
會長為了慶祝自己畢業舉行了慶典，魯魯修和咲世子兌換身份和會長玩起了遊戲..當Orange進行geass清除時剛好清楚了夏利的geass.......
第十三話（來自過去的刺客）
恢復記憶後的夏利陷入迷茫，Orange正式投靠魯魯修....但卻應geass身亡因此魯魯修決定.....（這集實在不想寫）
第十四話（Geass 狩獵）
命運多次被geass改變了的夏利, 因為Geass慘死. 在她死後傷心欲絕的Lulu, 發誓要鏟平那個研究Geass的團體---Geass教團 有了Rollo和Orange提供的情報, Lulu找到了教團總部的所在, 帶領著黑騎士團沖進去,在門口等待的是教團的少年領導, 和CC同樣擁有不死能力的VV, 帝國皇帝的哥哥.....
第十五話（C的世界）
在和皇帝對決時, Lulu被送到了神秘之女CC的世界. 他必須要和擁有著神秘能力的敵人戰鬥.
當Lulu絕望的時候, 那個出現在他面前的人是....
第十六話（超合集國決議的壹號）
建立壹個超合眾國來對於Britainnia的目標終於實現了, 47個國家合幷到了壹起, 以日本合眾國和中華合眾國為首. 現在世界被分成兩部分, Britainnia和超合眾國, 世界的政治形式將進入壹個新的時代
第十七話（土之味）
在11區, 壹場黑騎士團與帝國最強的軍隊之間的戰役將要開始. 同時, 為了某件事, Lulu向樞木家的神社走去, 朱雀在那兒等候. 他們的見面醞釀著種種想法, 他們的命運將在何方? 魯魯修和朱雀決定再次聯手時卻........
第十八話（第二次東京決戰）
這壹話不知怎麽的從我電腦裏消失了......
第十九話（背叛）
修乃澤魯親自前往黑色騎士團說明了zero就是魯魯修以及geass的事黑色騎士團就定.......魯魯修在在斑鳩內被扇、藤堂、等騎士團的殘黨所包圍，同是帝國剩余圓桌騎士亦出現在魯魯修面前，危難之時洛洛現身與騎士團鏖戰，最終身亡....
第二十話（不配為皇）
瑪麗安娜在啊尼亞體內醒來喚醒了C.C.的記憶...朱雀認為皇帝已失去作為王者的資格而去刺殺皇帝，魯魯修決定去往黃昏神殿與皇帝同歸於盡，在不理塔尼亞軍中制造了混亂....
第二十壹話（諸神黃昏連接）
在C的世界中魯魯修了解了九年前的真相以及瑪麗安娜和皇帝的願望...魯魯修否定了這願望並強行命令C的世界不要停下再此魯魯修真正的力量覺醒.........皇帝與瑪麗安娜被C的世界吞噬.....
第二十二話（皇帝魯魯修）
魯魯修繼任不理塔尼亞皇帝後完全的重組了不理塔尼亞，朱雀擊敗來犯的4名圓桌騎士魯魯修決定加入超合眾國，在阿修佛的學院內將超合眾國全體要員作為人質要求.......同時修乃澤魯啟動了達摩克裏斯並否定魯魯修作為皇帝而修乃澤魯口中更適合的人選竟是娜娜莉.
第二十三話（修乃澤魯的假面）
修乃澤魯利用黑色騎士團於魯魯修在11區進行了大規模交戰交戰中魯魯修敗退，魯魯修使用地下資源櫻石將戰局拉了回來，這時達摩克裏斯向魯魯修軍不斷投放Fleija....
第二十四話（達摩克裏斯之空）
激戰中星刻突入了Avalon，魯魯修和朱雀利用妮娜制造的對Fleija武器成功進入達摩克裏斯的內部，但卻遭遇了在達摩克裏斯中等待著他們的基諾......
第二十五話
魯路修把自己變成了人民的公敵，然後讓朱雀殺死自己從而打造了壹個全新的世界，人們過著幸福的生活，娜娜麗也最終理解了魯路修,新的世界走向未來。