之所以稱之為“單點應用”，是因為在這個階段，通常是作為個人使用的工具，並不涉及物流企業的業務流程和多個環節之間的信息交互。物流信息化的第二階段是對物流企業的單個業務流程或管理職能實施部門級的信息系統建設，通過信息處理活動的改進，優化和改善各個業務流程或管理職能的運作。這壹階段的信息化建設包括:運輸管理系統(TMS)、倉儲管理系統(WMS)、配送管理系統(DMS)、電子報關系統、在線跟蹤查詢系統、貨主企業與第三方物流企業的數據對接平臺等。以及各種通用信息系統，如OA系統、財務管理系統、人力資源管理系統等。
這壹階段的主要特點是增加了“過程”的概念，它涉及的不是單個環節或單個的信息加工活動，而是信息加工活動的多個環節。因此，需要按照壹定的流程協調多人多環節的信息處理活動，要求信息處理和業務處理流程統壹。物流信息化的第三階段是對整個物流企業的綜合管理實施企業級信息系統建設。這壹階段的信息化建設包括專用於物流企業的各種生產管理系統、管理信息系統和客戶關系管理系統，如包公公司提出的“物流行業的ERP”——總訂單管理系統(TOM)。
當然，壹些通用的綜合管理信息系統，如ERP、CRM等也可以直接使用，但效果不壹定很好。
第三階段，物流企業需要跨越部門的界限，實現各部門數據和信息的互聯互通，並在此基礎上實現信息的集中查詢和集中分發。
大量物流企業的信息化水平仍處於單點應用的第壹階段，約占物流企業總數的75%。