截至2014年4月，中國科學院軟件研究所有正式職工520人，其中院士3名，研究員58名，副研究員及高級工程師102名。國家傑出青年基金獲得者3人，中科院百人計劃入選者8人。
中國科學院院士： 姓名入選時間董韞美 1993年 周巢塵 1993年 林惠民 1999年 資料來源： 第三世界科學院院士： 姓名入選時間周巢塵 2000年 資料來源： 國家傑出青年基金獲得者： 序號姓名獲得時間1 馮登國 2000 2 張健 2001 3 李昂生 2003 資料來源： 截至2014年4月，中國科學院軟件研究所有軟件基礎研究部、軟件高技術研究部、軟件應用研究部和軟件發展研究部等4個研究部以及總體部，有國家工程研究中心2個，國家重點實驗室1個。
國家工程研究中心：基礎軟件國家工程研究中心、信息安全***性技術國家工程研究中心
國家重點實驗室：計算機科學國家重點實驗室 國際交流 根據2016年1月研究所官網信息，中國科學院軟件研究所和40多個國家與地區建立密切的學術聯系及多種形式的技術合作關系，平均每年邀請和接待國外學術界、企業界人士數百人次。圖靈獎獲得者Amir Pnueli、Tony Hoare、姚期智等國際著名科學家都曾到中國科學院軟件研究所訪問講學，周巢塵院士於1997至2002年擔任聯合國大學國際軟件技術中國科學院軟件研究所所長。
中國科學院軟件研究所與國際學術團體合作，主辦了多種重要國際學術會議。如，面向對象語言與系統技術國際會議、國際信息與通信安全國際會議、首屆亞太區萬維網技術與應用國際會議、亞洲邏輯和軟件工程國際會議、亞洲邏輯會議、APCHI亞太人機界面會議等，與壹些國際著名大學、研究機構和公司建立了合作關系。 ***建研發培訓機構 名稱合作機構ISCAS/USC-CSE軟件工程聯合實驗室 南加州大學 ISCAS/UMass-LASER軟件工程聯合實驗室 麻省大學 ISCAS/Altair高性能計算與網格計算軟件聯合研究中心 ---- ISCAS/UQITEE數據與軟件工程聯合研究實驗室 昆士蘭大學 NFS-China/Sun操作系統技術聯合實驗室 SUN公司 Mozilla中國中心 Mozilla Foundation 微軟高技術培訓中心 微軟公司 資料來源： 院地合作 根據2016年1月研究所官網信息，中國科學院軟件研究所與大學、科研機構合作聯合承擔科研項目、聯合培養研究生、聯合建立非獨立法人研究機構 、聯合舉辦學術會議及各種形式的學術交流，在青島、哈爾濱等地設立了分部。 院地合作***建研發機構 名稱合作機構北京市軟件生產和質量保證技術聯合實驗室 北京科委 工業管理與設計工程研究中心 雅戈爾集團 中國科學院寧波軟件開發中心 寧波市科委 江蘇中科軟件工程技術中心 江蘇軟件園 資料來源： 分部 中國科學院軟件中國科學院軟件研究所無錫分部 中國科學院軟件中國科學院軟件研究所重慶分部 中國科學院軟件中國科學院軟件研究所哈爾濱分部 中國科學院軟件中國科學院軟件研究所廣州分部 中國科學院軟件中國科學院軟件研究所青島分部 資料來源： 館藏資源 根據2016年1月研究所官網信息，中科院中國科學院軟件研究所圖書館是軟件專業特色圖書館，有館藏中西文計算機科學與軟件技術專業文獻2萬余種，園區IP可訪問國家科學圖書館和自行購買的近百種數據資源庫。 儀器設備 根據2016年1月研究所官網信息，中科院中國科學院軟件研究所構建了多個科學平臺，通過中科院儀器設備***享管理平臺通用儀器設備實現了公用***享，主要儀器設備如下表所示： 主要儀器設備 類別儀器設備服務器 HP ML370 G5、IBM System p5 51A、IBM System p5 52A、 IBM x366、IBM x3650、IBM x3755、IBM P720
刀片式服務器：IBM BladeCenter JS21、IBM HS21、IBM HS22、IBM LS21
機架式服務器：Dawning（曙光）天闊 620r-F、Dawning（曙光）天闊 840、Dawning（曙光）天闊 I950
cpu並行運算服務器 千億次刀片機群系統 曙光天闊服務器 S4800A1 、IBM BladeCenter H刀片中心 工作站 DELL 490、DELL 670、DELL Precision T7500 存儲設備 BM DS4300磁盤陣列、IBM 3581磁帶自動加載機 網絡設備 思科 PIX-525-UR-GE-BUN防火墻主機、思科 WS-C4506交換機 專業設備 Optech ILRIS-36D三維測量儀、VIVID 910三維數據化儀 資料來源：