南宋初年，天下動蕩，道佛爭鋒，魔門逞兇。杭州藥商之子許仙身不由己卷入江湖，被迫開始壹場瑰奇多姿的仙魔之旅。血海深仇，情怨糾葛，他命中註定要以壹己之力與世界為敵?
峨眉妖蛇白素貞、小青誤放被葛長庚囚於八卦丹爐中的魔帝林靈素，雖林靈素再次被封印，但消息傳出，致使佛道魔三教紛紛前往搶奪。許宣卷入其中，被托以鎮有林靈素的乾坤元炁壺，而其舅程仲甫卻勾結王文卿，陷害許家滿門，更令歷險逃離峨眉的許宣身陷囹圄，不得已放出林靈素。
林靈素從許宣、白素貞口中得知李師師消息，心生疑惑，向陸成仇求證後，挾持許宣與白素貞同往金陵，與李少微生死相搏，卻壹同落入轂中，被李師師的駝奴郭動天所擒。
郭動天卻又感念林靈素恩德，於秦淮河引來正道諸人激戰，借機放走林靈素，大戰後許宣林靈素等人皆受傷漂流入海，但白素貞不知所蹤。因此事恰逢金兵以炮船試圖刺殺趙構，許家被朝廷滿門抄斬。
幾人登上載有王文卿師徒及金國小王爺的大船，壹番爭鬥之後，諸人依靠青龍皮圖指引，破開結界登上真正的蓬萊仙山。林靈素、李少微因身受重傷，控制許宣、小青，令二人修煉兩儀電劍，以沖出鎮龍谷。
在王重陽幫助下，幾人沖出山谷。許宣、小青扮作伏羲、女媧轉世，得到蛇族信任，在青帝宮殿內亂中許宣又取得青帝好感。但王文卿卻向白乾天指出二人為冒充，小青、王允真、林靈素皆被王文卿挾持，許宣不得已與王文卿虛與委蛇。
許宣在青帝面前冒充周邦彥與李師師之子，得以認青帝為義母。李少微令王重陽救出林靈素等人，而後困青帝、許宣於乾坤元炁壺中，前往重陽比劍奪帝，卻被青帝、許宣脫困，王文卿被青龍所吞，身受重傷的青帝傳位於許宣，令其對決林靈素、李少微。
李少微殺死王允真，以嫁禍小青，令其無法與許宣雙劍合璧。許宣擊敗李少微，卻被棄李少微不顧的林靈素擊碎雙膝。這時王文卿自青龍腹中逃出，並帶出了當年進入青龍腹內鎮壓青龍的蛇族聖女，聖女元神附體於小青，將林靈素打敗。
原來被蛇族聖女帶入青龍腹中的白虎皮圖早已被李師師騙走，而王文卿進入青龍腹內也是出於李師師的算計。蛇族聖女試圖殺盡眾人，卻因小青心中之蠱被李少微引動而失敗，元神逃入王重陽體內。王文卿再次發動引龍訣，吸納青龍元魄化龍，大亂之中，許宣等人通過女媧留下的咒文脫離蓬萊，卻分散各方。
許宣被傳送到羅荒野，殺死曾吞食完顏蘇裏歌之父的雄白虎，被蘇裏歌之族人推為雄庫魯，又逼走覬覦蘇裏歌的完顏亮，完顏亮卻指使禦林軍殺入村寨，殺死阿勒錦，欲強搶蘇裏歌，許宣引狼群擊潰數百禦林軍，臨別之時，蘇裏歌明白向許宣示愛，贈予海東青，並誤認許宣名字為許仙。
許宣來到北海，發現魔門十祖之壹安羽臣率壹眾海盜為惡，遂冒充林靈素殺上海盜船，誅殺安羽臣，奪得狼雕號，卻也得知全家已被南宋朝廷盡數殺死的消息。接下來許宣又於海上救下完顏瑤與完顏雍，被完顏雍當做當年被白虎吞食的濟安太子，又發現王允真遺體被完顏瑤魂魄所附。
青龍脫困出現在北海，王重陽也隨之出現。狼雕號被青龍擊毀，完顏瑤也被青龍所吞，許宣、王重陽飛追青龍，遇上金兀術所乘戰船，金兀術不信完顏雍之言，懷疑許宣並非濟安太子，卻在許宣身上發現林靈素所造的胎記。
金兀術揮師追擊青龍，此時玄武出現，許宣與王重陽合力，終於重創青龍。李師師出現，將青龍兇靈鎮壓，把王文卿擒住，又挾持許宣，於火山口逼問林靈素下落，但王文卿突然暴起，抱著李師師墮入火山。
許宣受傷之後連番惡戰，全身經脈皆毀，卻於北海悟出混沌壹炁訣（盤古大法），並修成混沌之身，又從菌人口中得知混沌皮圖和金缽蓋被林靈素與小青騙走，才導致玄武脫困。
於鎮伏玄武的過程中，許宣被玄武所擊傷，陷入沈睡，被王重陽認為已死，置於北極亡靈之塔附近，數年後被花神谷諸女發現帶上船，隨即慈航靜齋諸尼上船擒住花神諸女，冒名頂替前往不夜城赴殷紂之女與展子夜之婚禮。
諸尼被魔門洛原君接走，花神谷眾女與許宣則被留在船上。飛劍門道士找到被困的花神諸女，欲行奸殺後再去追尋諸尼蹤跡，這時許宣蘇醒，自稱許仙，斬殺張若無等人，救下花神眾女。接下來，許仙繼續偽裝林靈素。
前往不夜城的魔門高手與許仙等聚集，道門高手亦追逐而至，諸尼表明身份，與道門眾壹同擊散魔門諸人。許仙於激戰之中，被酷似白素貞的白玉蟾所敗而擒住。
正派諸人審問許仙，但白玉蟾對慧真遇刺壹事有疑慮，認為並非林靈素所為，招致正道諸人圍攻，和許仙壹同落海掉入鯨魚肺中，白玉蟾卻取得半卷玄武骨圖，並擒住不夜城主殷紂。
出離鯨魚後，李師師出現，對白玉蟾身軀下蠱，白玉蟾身份顯露，原來是慧真故意被李師師刺殺，寄元神於白素貞。兩人不敵李師師，慧真誆住許仙，以其為誘餌，自己逃去，殷紂也被李師師擒下，許仙被迫與李師師結盟。
許仙與玄武合作，以林靈素弟子“完顏濟安”身份假裝擒住玄武，樹立聲望，欲爭魔帝之位。