根據主體功能區戰略，主體功能區的劃分在國家和省級兩個層面上開展[6]。國家層面，主要確定全國國土空間開發的總體框架，明確國家級主體功能區，但不覆蓋全部國土空間，為省級主體功能區的劃分留有余地。省級層面，根據全國國土空間開發的總體框架，以縣級行政區為基本單元，確定本行政區各類主體功能區數量和範圍，國家級與省級主體功能區合在壹起覆蓋全部的國土空間。按照開發方式，國土空間劃分為四類：優化開發區域、重點開發區域、限制開發區域和禁止開發區域[7]。開發的含義是指“大規模高強度的工業化城鎮化開發”。通過確定不同國土空間的開發方式，實現對區域內的工業化和城鎮化活動的規模和強度進行約束，使人類活動主動順應地理地質環境的框架性制約，提高自然背景條件與社會經濟發展格局的匹配程度，促進人地和諧。按照開發內容，國土空間劃分為三類：城市化地區、農產品主產區和重點生態功能區。城市化地區以增強綜合經濟實力為首要任務，以提供工業品和服務產品為主體功能；農產品主產區以增強農業綜合生產能力為首要任務，以提供農產品為主體功能；重點生態功能區以增強保護和修復生態環境能力為首要任務，以提供生態產品為主體功能。從不同角度劃分的各類主體功能區相互關系如圖6–1所示。
根據主體功能，我國國土空間的總體格局由城市化、農業發展和生態安全三類格局組成。城市化格局以“兩橫三縱”為主體，即以陸橋通道、沿長江通道為兩條橫軸，以沿海、京哈京廣、包昆通道為三條縱軸，空間上包括環渤海、長三角、珠三角3個優化開發區域，冀中南地區、太原城市圈、呼包鄂豫地區、哈長地區、東隴海地區、江淮地區、海峽西岸經濟區、中原經濟區、長江中遊地區、北部灣地區、成渝地區、黔中地區、滇中地區、藏中南地區、關中—天水地區、蘭州—西寧地區、寧夏沿黃地區、天山北坡地區等18個重點開發區域。農業發展格局以“七區二十三帶”為主體，即以東北平原、黃淮海平原、長江流域、汾渭平原、河套灌區、華南和甘肅新疆等農產品主產區為主體，二十三帶指七區中以水稻、小麥等農產品生產為主的二十三個產業帶。生態安全格局以“兩屏三帶”為主體，即以青藏高原生態屏障、黃土高原-川滇生態屏障、東北森林帶、北方防沙帶、南方丘陵山地帶以及大江大河重要水系為骨架，以其他國家重點生態功能區為重要支撐，以點狀分布的國家禁止開發區域為重要組成。
各省主體功能區劃分情況統計如表6–2所示。根據31個省份主體功能區規劃統計，31個省份覆蓋國土面積960×104km2，其中，國家級主體功能區約占66.1%，省級主體功能區約占33.9%。具體地說，優化開發區域13.43×104km2，占1.4%；重點開發區域132.39×104km2，占13.8%；農產品主產區252.54×104km2，占26.3%；重點生態功能區538.10×104km2，占56.1%（圖6–2）。禁止開發區域呈點狀分布於優化開發區域、重點開發區域、農產品主產區、重點生態功能區之中，面積194.58×104km2，占20.3%。可以看出，優化開發區域主要分布在北京、天津、河北、遼寧、上海、江蘇、浙江、山東和廣東等沿海省、市，而禁止開發區域主要分布在黑龍江、內蒙古、四川、青海、新疆等省、自治區。
圖6-1 主體功能區劃分示意圖
表6-2 各省主體功能區（按開發方式）分布情況 （單位：104km2）
續表
註：①除青海、寧夏等個別省份外，優化開發、重點開發和限制開發區域面積未扣除禁止開發區域面積；②黑龍江、上海、江西、江蘇、重慶等省份禁止開發區域面積為估算面積。
從主體功能區分布來看（圖6–3），在空間布局上有以下特點：
（1）主體功能區布局總體上順應了地理地質環境的框架性制約。我國陸地地勢西高東低，自西向東呈階梯狀下降，形成陸域三級階梯。三級階梯的分界線分別由兩條山嶺組成：昆侖山—祁連山—橫斷山壹線和大興安嶺—太行山—巫山—雪峰山壹線。承載人類經濟社會發展和適宜人類居住的理想地區，主要集中在大興安嶺—太行山—巫山—雪峰山壹線以東地區。從主體功能區空間布局來看，優化開發區域和重點開發區域主要分布於大興安嶺—太行山—巫山—雪峰山壹線以東地區，而重點生態功能區則主要分布在該線以西地區。據中國科學院可持續發展研究組研究成果，以世界大陸平均海拔為基準，每增加100m的高度，區域發展成本將提高2.2%～2.4%[8]。在海拔較低的平原地區，經濟發展的成本相對較低。大興安嶺—太行山—巫山—雪峰山壹線以西地區平均海拔大大高於以東地區。因此，主體功能區布局順應地理地質環境的框架性制約，既是尊重自然規律的體現，也是遵從經濟規律的結果。
圖6-2 全國各類主體功能區（按開發方式）面積分布情況
（單位：104km2）
圖6-3 全國主體功能區劃分圖
（2）生態空間環繞生產與生活空間成片分布，生態功能區凸顯。隨著我國工業化、城鎮化的持續推進，農業用地和生態用地被無序開發的同時，農業生產又擠占了大量本可以用於生態的空間，導致草原退化，濕地、水面等生態空間萎縮，生態系統整體功能退化，生產和生活空間的宜居性越來越差[9]。全國與各省主體功能區規劃確定的主體功能區布局扭轉了這壹趨勢，開發區域（包括優化開發和重點開發區域）被嚴格限定，其面積僅占國土面積的15.2%左右，而生態功能區的面積達到了國土面積的56.1%，加上禁止開發區域，以提供生態產品為主要功能的區域可能達到國土面積60%～70%。過去壹度被經濟發展所忽略的生態功能，通過主體功能區規劃，得到空前重視和加強，為實現生產、生活和生態協調發展和“三生”***贏奠定了基礎。
（3）城市化地區從沿海密集分布逐漸過渡為內陸零散分布。與我國區域發展總體戰略相適應，主體功能區規劃所確定的城市化地區自東向西呈減小趨勢。東部地區城市化地區面積為31.37×104km2，占其國土面積的33.8%；中部地區22.68×104km2，占22.1%；西部地區79.25×104km2，占11.6%（表6–3）。重點生態功能區分布則與此相反，由東向西呈擴大趨勢，占國土面積比例由東部的27.9%，到中部地區增至37.6%，到西部地區增至63.2%。2005年以後國家出臺了20余個區域發展規劃，有20個重要經濟區被納入國家發展戰略，其中東部地區分布有8個重要經濟區，中部地區分布有6個重要經濟區，西部地區則分布有3個重要經濟區[10]。東部、中部地區的重要經濟區引領著全國經濟的發展，是全國經濟發展的高地。因此，城市化地區的布局與全國經濟發展的布局總體上是壹致的。
表6-3 各區域各類主體功能區（按開發內容）面積與占國土面積比例
註：①東部地區：北京、天津、河北、山東、江蘇、上海、浙江、福建、廣東、海南；②中部地區：山西、安徽、江西、河南、湖北、湖南；③西部地區：雲南、貴州、四川、重慶、廣西、甘肅、青海、寧夏、西藏、新疆、陜西、內蒙古，暫缺重慶和西藏數據；④東北地區：遼寧、吉林、黑龍江。