尋秦記大結局是：十年後項少龍在塞外，已經娶了烏芳跟秦青。烏芳給項少龍生了個孩子取名項小龍，秦青也懷孕了。
大結局劇情：
少龍擁著琴清和廷芳***賞落日美景，善柔突然出現，悄悄地向少龍示愛，少龍頓時不知所措。嬴政以壹半江山及師徒情義試探少龍，少龍心知伴君如伴虎，不為所動，嬴政見狀心有決定。
少龍帶二女等離開鹹龍陽君城，赫見王翦率兵守在城門阻攔，少龍心下壹沈。少龍等順利返回烏家堡，即接報嬴政親率大軍來捉少龍，少龍吩咐眾人躲進趙雅的衣冠冢內。
自己欲與嬴政來個同歸於盡，琴清和廷芳猜到其心意，誓要生死與***。十年後項少龍在塞外，已經娶了烏芳跟秦青。烏芳給項少龍生了個孩子取名項小龍，秦青也懷孕了。
最後壹幕是項小龍指著天上的飛鷹說自己要改名叫項羽覺得項小龍這名不夠霸氣，項少龍知道歷史裏項羽的悲慘結局所以追著項小龍讓他換個名字。
劇集評價：
《尋秦記》改編劇叫好又叫座（北京娛樂信報評）；該劇把金庸之後的香港新派武俠宗師黃易第壹次介紹給了中國內地觀眾，作為第壹部80%外景在中國內地取景的大制作，壹改TVB小氣簡陋的攝影捧搭景的弱項，人美景美音樂美。
加上匪夷所思的情節和交錯不清的愛情故事，《尋秦記》算得上是TVB改編小說的又壹經典（新浪娛樂評）。該劇在穿越時空的基礎上加入現代元素，把武俠和科幻結合，是穿越劇的最早代表，可謂穿越劇的“鼻祖”。