國家保護動物有大熊貓、熊猴、白鰭豚、金絲猴、華南虎、麋鹿、藏羚羊、褐馬雞、黑頸鶴、揚子鱷、朱鹮、梅花鹿等。
大熊貓，棲自在海拔1400至3500為的高山竹林裏，主要以竹筍、竹葉及嫩竹尖為食。此大熊貓只產於我國的四川、甘肅、陜西等地，是世界珍貴物種。熊猴是靈長目獼猴屬下的壹種猴子，別稱蓉猴、阿薩姆猴、山地獼猴等，體型大小與獼猴相似。
白鰭豚是中國特有的淡水鯨類，別稱白鱀、白旗、白鰭等，僅產於長江中下遊。金絲猴也稱為仰鼻猴棲息於2000～3000高海拔地區，植食，有垂直遷徙的習性，群居，有豐富的社群行為，有多種的喊叫聲。
飛禽類和爬行類
短尾信天翁、白腹軍艦鳥、白鸛、黑鸛、朱鹮、中華秋沙鴨、金雕、白肩雕、玉帶海雕、白尾海雕、虎頭海雕、擬兀鷲、胡兀鷲、細嘴松雞、斑尾榛雞、雉鶉、四川山鷓鴣、海南山鷓鴣、黑頭角雉、紅胸角雉、黃腹角雉、灰腹角雉、虹雉、褐馬雞、藍鷴、黑頸長尾雉、白頸長尾雉、黑長尾雉、孔雀雉、綠孔雀、黑頸鶴、白頭鶴、丹頂鶴、白鶴、赤頸鶴、鴇、遺鷗。
穿山甲屬是鱗甲目穿山甲科的壹個屬，***有4個物種，地棲性哺乳動物，另外爬行類還有四爪陸龜、黿、鱷蜥、巨蜥、蟒、揚子鱷等。昆蟲類有太白虎鳳蝶、金斑喙鳳蝶、金裳鳳蝶、陽彩臂金龜等。