1、遊戲模式不同：假面騎士鬥騎大戰1只有單人模式，玩家可以選擇壹個角色進行遊戲，而假面騎士鬥騎大戰2則加入了多人模式，可以和其他玩家進行對戰。
2、角色數量不同：假面騎士鬥騎大戰1有13個可玩角色，包括假面騎士和怪獸等，而假面騎士鬥騎大戰2則增加了更多的角色，包括新的假面騎士和怪獸。
3、畫面質量不同：假面騎士鬥騎大戰2的畫面質量更加優秀，表現更加流暢，效果更加逼真。
4、遊戲玩法不同：假面騎士鬥騎大戰2加入了更多的遊戲玩法，如使用Wii遙控器進行操作、多人對戰等等，增加了遊戲的趣味性和可玩性。