杭州灣信息港采用“政府主導、企業專業化運營”方式，即政府和企業合作運營園區，探索實行政府投資建設、專業企業托管的園區創新運營模式。具體講：蕭山經濟技術開發區管理委員會作為投資建設信息港項目的政府壹方，有意按照“政府主導，企業專業化運營”的方式，通過成立下屬國資公司即浙江杭州灣信息港高新建設開發有限公司對本項目實行委托運營管理，通過組織專家比選，選中合作機構（浙大網新集團）承擔本項目的招商運營管理工作。中選機構願意承擔本項目的運營管理工作，並接受政府方的考核與監督，同時在政府方的支持下，完成項目的運營管理目標。