潛伏期為2～30天，壹般2～6天，臨床上分為急性型和慢性型。
急性型（敗血病）：多見於斷奶後不久的仔豬。體溫升高至40.5～41.6℃。病初便秘，以後下痢，糞便黃色、惡臭，有時帶血，弓背尖叫。耳、腹部及四肢呈紅色，後期呈青紫色，最後呼吸困難，體溫下降，痙攣，病程4～10天。死後剖檢，脾腫大，邊緣鈍；肝、腎腫大出血；腸系膜淋巴結索狀腫大，並呈大理石樣；心內膜、心外膜、膀胱、胃黏膜均有出血斑。
慢性型（結腸炎型）：體溫偏高，便秘和下痢交替出現，糞便呈灰白色，淡黃色或暗綠色，形同粥狀，惡臭，有時帶血和壞死組織碎片，皮膚上出現痂樣濕疹，病程2～3周。死後剖檢主要病變在盲腸和大結腸，腸壁增厚，黏膜上覆蓋灰黃色彌漫性腐乳狀物質，剝開底呈紅色，有潰瘍面；脾和腸系膜淋巴結腫大，常見到針尖大至粟粒大的灰白色壞死竈，這是豬副傷寒特征性病變。