2230年出生於瓦肯星的男孩史波克（紮克瑞·昆圖 Zachary Quinto 飾），因為母親阿曼達·格雷森（薇諾娜·賴德 Winona Ryder 飾）是人類，經常遭到同僚的嘲笑和欺負。父親薩瑞克（本·克勞斯 Ben Cross 飾）是瓦肯星的壹名外交官，史波克從小就不斷地在嚴肅的瓦肯邏輯教育和他的人類情感之間掙紮。
而來自未來的老年史波克（倫納德·尼莫伊 Leonard Nimoy 飾）因穿越時空，告訴了柯克未來羅慕倫帝國的殘余勢力尼諾（艾瑞克·巴納 Eric Bana 飾）也已經回到現在，並率領大隊人馬進行復仇，尼諾摧毀了史波克的家鄉瓦肯星，下壹個目標便是地球……