1、V2主板早已完美破解，關機不用刷機和壹鍵刷機。而V3主板關機後還要再刷機或壹鍵刷機（V3不是完美破解，只能待機）。
2、V3主板不能降級。
3、V2關機後可以直接運行iso遊戲，V3主板5.03HENR2系統關機後就不能直接運行iso遊戲，必須刷成5.03GEN-C的自制系統才行。
4、V3主板iso遊戲文件名不支持中文，必須改為英文。大致上都沒其他區別了。
5、總體上講2000V2還是完全勝過V3，V3主板在破解方面還有不足之地，2000都早已停產了，除了是翻新機或二手機外，基本買不到新機。