跨境電商和跨境物流高度正相關，兩者之間存在長期穩定均衡的關系，互為因果。長期來看，跨境電商與跨境物流的關系主要表現為相互正向促進，但也存在壹定的相互抑制關系，跨境電商對跨境物流的長期依賴性強於跨境物流對跨境電商的依賴性。
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跨境電子商務與跨境物流發展存在諸多不協調，主要表現為能力協調不足、利益互信協調機制缺失、跨境物流網絡體系協調不足、跨境電子商務與逆向物流協調不足、跨境電子商務與傳統外貿協調不足。
跨境電子商務與跨境物流可以從多方面推進，如完善政府支持服務體系、完善利益互信合作機制、優化跨境電子商務與逆向物流的合作、促進跨境電子商務與傳統外貿的合作、促進子系統與多主體的合作等。