壹、直接經濟效益評價是指在MIS實施過程中，計算機管理節省的費用與壹次性投資(包括軟硬件投資)的折舊和運行費用的比較。管理信息系統的應用增加了投資和壹些費用，但可以減少管理人員，減少了工資和人工成本。通過實現管理現代化，節約材料消耗，降低成本消耗，減少庫存資金，節約管理費用，堵塞資金漏洞等。科學的規劃和決策能帶來更不可估量的經濟效益。
二、間接經濟效益評價是指企業在提高管理效率和數據集中管理方面，以及建立網絡系統後數據傳輸的及時性和準確性方面，對企業運行MIS後能夠實現實時、定量管理，提高企業競爭力的效益的評價。主要表現在通過管理手段提高整體管理水平所帶來的綜合經濟效益。這樣的綜合效益往往需要壹段時間才能體現出來，越發展到高級階段，這樣的效果越明顯，對企業產生質的、戰略性的影響。主要體現在企業管理自動化、基礎數據現代化、管理體系合理化、管理決策科學化、管理效果最優化等方面。
(2)但是，由於信息系統工程不同於壹般工程，其投資不能是壹次性投資，也不能僅僅是硬件上的投資。隨著系統的建設和運行，會產生壹系列不明顯的費用(如開發費用、軟件費用、維護費用、運行費用等。)，而且這些費用的比重越來越大。然後，信息系統的有效性被強烈地延遲、關聯和不清楚。信息系統的效益是在系統建成後經過相當長時間的使用後才會發生的，信息系統的效益與管理制度、管理基礎、用戶的使用熱情、用戶的技術水平密切相關。
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