PHEIC和疫區國有以下不同：概念不同、時效不同、影響不同。
1、概念不同
PHEIC不是對相關部門采取防治措施的評價，而是代表疾病所在地區及國際的疾病風險，以及對加強和協調疾病控制的需要。世界衛生組織同時對中國、所有國家和全世界提出了壹些建議。
動物疫病流行國家/地區是指病毒或病菌所能傳播的國家或地區，疫病流行區的範圍大小受傳播方式和環境條件的限制。
2、時效不同
PHEIC臨時建議有效期是三個月，三個月後自動失效，意味著每三個月就會進行壹次重新評估。
動物疫病流行國家/地區是指病毒或病菌所能傳播的國家或地區的時效是沒有壹個評價標準的，因為動物的傳播範圍根據它們活動的幅度大小而定，當傳染源病數目達到壹定數量，而且相互交叉、擴大、重疊時形成疫區。
3、影響不同
世衛對PHEIC的宣告並不能授權國際社會針對疫情發生國進行任何強制性的幹預措施。世衛給出的建議，即使是涉及到與旅遊和貿易相關的限制，也都不是強制性的。
其給成員國給出的貿易及出行警示建議也僅僅是建議，並不是強制措施。別國是否會與中國進行貿易，以及是否會對中國人出行實施限制完全取決於人家對疫情嚴重程度的判斷，而不是是否被宣布 PHEIC。
動物疫病流行國家/地區是指病毒或病菌所能傳播的國家或地區控制更嚴格，從疫區出口的貨物也將面臨更加嚴格的檢驗和檢疫。
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