壹是前瞻性和戰略引導性原則。“中關村指數”是在深入研究科技園區發展路徑和發展規律、總結全球科技創新中心的內涵特征基礎上，以科學發展、創新發展、持續發展的戰略思想為指導開展研究和編制工作。比如中關村指數的壹級指標“產業發展”中，除了包括產業規模指標外，還設置了效益、結構和輻射帶動等指標，矯正當前實踐中部分科技園區單純以GDP為導向的錯誤理念，引導科技園區回歸以創新為驅動，發展高新技術產業的根本任務。又如壹級指標“創新創業環境”下單獨設置了“社會環境”指標，旨在反映園區所在區域的城市品質和宜居宜業環境，體現了“產城融合”的先進理念。
二是符合中關村發展實際和體現中關村特色原則。中關村作為我國改革開放的“試驗田”和創新發展的“排頭兵”，新事物、新現象、新模式、新機制不斷出現。基於壹個固化指標體系的常規合成指數方法，很難全面描述和及時監測中關村這樣壹個日新月異、跨越發展的科技園區。經過幾年的摸索和實踐，通過借鑒“矽谷指數”的編制經驗，“中關村指數”形成了壹套開放式指標體系，既包括了監測科技園區發展狀況的常規指標，也納入了科技金融、開放實驗室等具有中關村特色的指標，從不同角度更為細致地刻畫中關村的創新發展。
三是資源開放、獨立客觀原則。“中關村指數”的研究和編制廣納智慧，由第三方智庫機構組織了壹批持續關註科技園區、具有較為豐富研究經驗的研究人員聯合開展攻關，聘請了壹批科技創新和統計計量領域的知名學者深度參與，也得到了壹批中關村創業者們的支持。指數的編制過程，特別是在數據采集方面，得到了政府相關部門的支持。