目前，中國電子商務處於對傳統商業模式和國外商業模式的復制和模仿水平，結合中國國情的創新模式較少。理論上，與傳統商務相比，電子商務有很多優勢。但由於種種原因，網站的爆發式增長與網站燒錢的虧損形成了極大的反差。企業信息化水平很低，企業信息化離不開電子商務，而電子商務是電子商務的基礎。企業信息化的落後嚴重制約了我國電子商務的發展。作為電子商務的主體，業務流程和管理流程的信息化是企業開展電子商務的必要前提。社會信用體系尚未形成。在市場經濟中，良好的信用對企業起著重要的作用。可以帶來穩定的供應商和客戶以及各種額外的收益。
電子商務是信息技術和傳統商務的有機結合。它需要大量既掌握現代信息技術又掌握現代商業理論和實踐的復合型人才。壹個國家或地區能否培養出大量這樣的復合型人才，已經成為那個國家或地區電子商務發展最關鍵的因素。電子商務政策法規不完善，電子商務是壹項復雜的系統工程。它不僅涉及交易雙方，還涉及不同地區和國家的工商、海關、保險、稅務、銀行等部門。這需要壹個統壹的法律和政策框架，以及壹個強有力的跨區域和跨部門的協調機制。同時，電子商務的支撐體系不健全，與電子商務相適應的信息基礎設施、物流配送體系、金融支付體系、信息安全體系不完善。
要區別對待不同的問題，傳統商業領域也存在假冒偽劣、誠信缺失等問題。因此，政府應加強監管，積極維護正常的市場交易。電子商務交易的特點也帶來了壹些問題，如網關認證和網絡安全。