1.加強基礎研究的頂層設計和統籌協調。加強統籌規劃，集中資源要素，瞄準世界科技發展前沿，突出原始創新。在國家科技計劃(專項、基金等)部際聯席會議機制下。)，成立基礎研究戰略咨詢委員會，研判基礎研究發展趨勢，開展基礎研究戰略咨詢，提出我國基礎研究重大需求和工作部署建議。加強中央、地方和中央部門之間的協調，促進軍民基礎研究融合發展。結合建設世界壹流科研機構、世界壹流大學和壹流學科，推動基礎研究中的科教融合。
2.建立基礎研究多元化投入機制。加大中央財政對基礎研究的支持力度，完善對高校、科研院所和科學家的長期穩定支持機制。采取政府引導、稅收杠桿等方式，實施R&D費用加計扣除等政策，探索新建R&D機構、聯合資助和慈善捐贈等措施，鼓勵企業和社會力量加大基礎研究投入。探索由中央和地方共同出資組織實施國家重大基礎研究任務的新機制。地方政府要根據當地經濟社會發展的需要，加大對基礎研究的支持力度。
3.進壹步深化科研項目和經費管理改革。完善符合基礎研究規律的項目組織、申報、評估和決策機制，在選擇基礎研究項目時更加註重研究方向、人才隊伍及其創新能力。簡化基礎研究項目的任務書和預算書，落實法人單位和科研人員的經費使用自主權，讓科研人員有足夠的時間專註於科學研究，讓經費服務於人的創造性活動。探索直接委托國家科技創新基地承擔國家科研任務的機制。
4.促進基礎研究和應用研究的融合。在重視原創性、顛覆性發明的基礎上，大力推進智能制造、信息技術、現代農業、資源環境等重點領域的應用技術創新，通過應用研究將原始創新與產業化聯系起來。創新體制機制，促進基礎研究、應用研究和產業化融合，推動科研院所、高校、企業、創客等創新主體合作融合，使國家重大科技項目成為創新的重要載體。充分發揮企業特別是轉制科研院所在產學研深度融合中的作用，推進基礎研究和應用研究的工程化，吸引國內外資金和技術，提升產業競爭力。適應互聯網時代創新活動開源、開放的新趨勢，創新基礎研究組織形式，探索基礎研究眾包、眾籌，舉辦多種形式的創新挑戰賽，加強知識產權保護，建立集體思維、智慧和解決問題的眾創空間。
5.促進科技資源的開放和共享。加強國家科技資源服務平臺建設和科學數據管理，統籌國家科技創新基地規劃布局，推進國家科學數據中心、國家種質資源庫、人類遺傳資源和實驗素材庫(館)建設，推進國防科技資源開放。面向重要基礎科學問題和戰略需求，加強基礎和公共自然背景數據、種質、標本等基礎科技資源的收集。完善國家科技報告制度，推動更多國家重大科技基礎設施、科學數據和儀器設備向各類創新主體開放。加強對新購大型科研儀器的審核，建立健全科研設施和儀器的管理機制和後補助機制。發揮創新券在促進科研設施和儀器開放獲取中的作用，強化法人單位開放獲取的主體責任和義務。
6.建立健全符合基礎研究特點和規律的評價機制。開展基礎研究差異化評價試點，對不同高校和科研院所開展分類評價，制定相應標準和程序，完善以創新質量和學術貢獻為核心的評價機制。自由探索基礎研究主要評價研究的原創性和學術貢獻，探索長期評價和國際同行評價；目標導向基礎研究主要評價解決重大科學問題的有效性，加強過程評價，建立長效監管機制，提高創新效率。支持高校、科研院所自主布局基礎研究，擴大高校、科研院所學術自主權和個人科研課題選擇權。完善科技獎勵等激勵機制，增強科研人員的榮譽感；建立鼓勵創新、容忍失敗的容錯機制，鼓勵科研人員大膽探索、挑戰未知。
7.加強科研誠信建設。堅持科學監管與誠信教育相結合，教育引導科研人員堅守學術誠信，恪守學術道德，完善學術人格，維護學術尊嚴。指導高校和科研院所建立健全學術管理制度，跟蹤評估研究人員的學術成長軌跡和學術水平，加強重要學術成果的評審和學術控制。抓緊制定對科研不端行為“零容忍”，樹立正確的科研評價導向，加大對科研造假的打擊力度，夯實我國科研誠信基礎。
8.推動科學普及，弘揚科學精神和創新文化。充分發揮基礎研究在傳播科學理念、弘揚科學精神和創新文化方面的重要作用，鼓勵科學家向公眾普及科學知識。推動國家重點實驗室等創新基地面向社會開展多種形式的科普活動。