1集小智和皮卡丘前往阿羅拉地區旅行，自然資源豐富的阿羅拉地區也極具魅力。在那裏，小智與新的精靈寶可夢們相遇，並且了解到了精靈寶可夢學校。興奮不已的小智在夜晚被壹個不可思議的聲音所引導...
2集因為被阿羅拉地區所吸引，小智和皮卡丘選擇留宿在庫庫伊博士家，並且進入精靈寶可夢學校學習。有壹天，小智的同班同學為小智舉辦了壹場秘密歡迎會。在熱鬧的歡迎會上，阿羅拉地區的守護神卡璞?鳴鳴來訪了...？
3集小智從庫庫伊博士那兒得到了壹只被稱為“洛托姆圖鑒”的會說話的寶可夢圖鑒，拿到圖鑒後，小智帶著皮卡丘和洛托姆圖鑒與他的同學們壹起興高采烈地前往森林捕捉野生寶可夢。另壹方面，火箭隊三人組收到阪木的指令，也來到了阿羅拉。