1.核能電廠會產生高低階放射性廢料，或者是使用過之核燃料，雖然所占體積不大，但因具有放射線，故必須慎重處理，且需面對相當大的政治困擾，較易引發政治歧見紛爭。2.核能發電廠熱效率較低，因而比壹般化石燃料電廠排放更多廢熱到環境裏，故核能電廠的熱汙染較嚴重。3.核能電廠投資成本太大，電力公司的財務風險較高。4.核能電廠較不適宜做尖峰、離峰之隨載運轉。5.核電廠的反應器內有大量的放射性物質，如果在事故中釋放到外界環境，會對生態及民眾造成傷害，（據核電專家詳解，嚴格按照核電安全標準執行，發生事故的概率微乎其微），因此，核安全也是我國核電站建設的重要內容。